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Micrococcaceae

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Micrococcaceae
Datei:M.l..jpg

Micrococcus luteus, lichtmikroskopisches Bild nach Gram-Färbung.

Systematik
Domäne: Bakterien (Bacteria)
Reich: Terrabakterien (Bacillati)
Abteilung: Actinomycetota
Klasse: Actinomycetes
Ordnung: Micrococcales
Familie: Micrococcaceae
Wissenschaftlicher Name
Micrococcaceae
Pribram 1929
emend. Zhi et al. 2009<ref name="lpsn_familia" />

Die Micrococcaceae sind eine Bakterienfamilie. Die deutsche Bezeichnung Mikrokokken (eingedeutschter Plural aus dem latinisierten Singular Micrococcus, der sich aus den beiden altgriechischen Bestandteilen {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Vorlage:lang:103: attempt to index field 'wikibase' (a nil value) und {{Modul:Vorlage:lang}} Modul:Vorlage:lang:103: attempt to index field 'wikibase' (a nil value) zusammensetzt)<ref name="GEMOLL" /> stellt den Trivialnamen mehrerer Arten grampositiver, unbeweglicher, aerober, in der Regel nicht pathogener Kokken (kugelförmige Bakterien) dar. Sie waren ursprünglich der Gattung Micrococcus zugeordnet, einige gehören aber mittlerweile anderen, verwandten Gattungen an, daher wird die Bezeichnung Mikrokokken auch für die Familie der Micrococcaceae verwendet. Bei vielen Vertretern der Familie ist bereits durch den Gattungsnamen erkennbar, dass es sich bei ihnen um Kokken handelt, z. B. Citricoccus. Aber auch Bakterien, deren Zellen stäbchenförmig sind oder die sich in ihrem Lebenszyklus von einer Kokkenform zu Stäbchen entwickeln, gehören der Familie an, beispielsweise Arten der Gattung Arthrobacter und verwandter Gattungen.

Merkmale und Vorkommen

Es handelt sich um nicht aktiv bewegliche Bakterien mit aeroben Stoffwechsel. Die grampositiven kokkenförmigen Zellen sind in Trauben, Haufen, paarweise oder in kurzen Ketten angeordnet. Typisch ist ihr hoher GC-Gehalt im Genom.<ref name="taxo1" /> Viele „Mikrokokken“ sind Bewohner von Böden, Schlämmen und Oberflächenwasser. Vertreter einiger Arten werden häufig auf der Haut und den Schleimhäuten von Menschen und Tieren gefunden. Einige Arten finden sich in (insbesondere fermentierten) Lebensmitteln und tragen dort zur Geschmacksbildung bei. Bei abwehrgeschwächten Personen und im Zusammenhang mit implantierten Fremdkörpern sind für einige Vertreter, wie Arten der Gattungen Kocuria und Kytococcus, Infektionen beim Menschen beschrieben.

Mitglieder der Gattung Arthrobacter sind typische Bodenbewohner. Sie sind von pleomorpher Gestalt und besonders widerstandsfähig gegen Nahrungsmangel und Austrocknung. 2016 wurden viele Arthrobacter-Arten in neu beschriebene Gattungen gestellt.<ref name="IJSEM_66_9" />

Systematik

Historische Entwicklung

Die heutige Familie Micrococcaceae<ref name="taxo1" /> entspricht in ihrer Zusammensetzung nicht mehr der früheren Familie gleichen Namens. Zu dieser gehörte u. a. auch die Gattung Staphylococcus, die allerdings keine engere verwandtschaftliche Beziehung zu den „Mikrokokken“ besitzt.<ref name="brock" /> Zur Familie Micrococcaceae werden u. a. die Gattungen Kocuria, Micrococcus und Nesterenkonia gezählt, die 1995 aus der ursprünglichen Gattung Micrococcus entstanden. Auch die Gattungen Dermacoccus und Kytococcus wurden früher der Gattung Micrococcus zugerechnet,<ref name="IJSEM_45_4" /> sind jedoch nun der Familie Dermacoccaceae zugehörig.<ref name="taxo3" /> Beide Familien gehörten zur Unterordnung Micrococcineae in der Ordnung Actinomycetales (Stand 2009). Weitere phylogenetische Untersuchungen der 16S rRNA führten zu einer neuen Systematik der Actinobacteria,<ref name="IJSEM_59_589" /> die 2012 in der 2. Auflage des Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology vorgestellt wurde. Darin wurden die Unterklassen zu Klassen und die Unterordnungen zu Ordnungen angehoben. Somit gehört die Familie Micrococcaceae nun zur Ordnung Micrococcales (Stand 2018).<ref name="lpsn_phylum" />

Im Rahmen der Entdeckung mehrerer neuer Bakterienspezies zu Beginn des 21. Jahrhunderts wurden diese zunächst in einer neuen, eigenständigen Familie Yaniaceae fam. nov. (2005)<ref name="IJSEM_55_1933" /> klassifiziert, die später in Yaniellaceae fam. nov. (2008) umbenannt wurde.<ref name="IJSEM_58_525" /> Diese beiden Taxa stellen jedoch lediglich Synonyme für die Familie Micrococcaceae dar<ref name="taxo1" /> und die neu entdeckten Bakterien der Gattung Yaniella gehören seit 2011 zur Familie Micrococcaceae.<ref name="lpsn_familia" />

Ende 2012 wurde die Familie Micrococcaceae um eine neue Gattung Enteractinococcus gen. nov. erweitert. Enteractinococcus coprophilus sp. nov. ist die Bezeichnung für die dazugehörige Bakterienart, die aus dem Kot eines Südchinesischen Tigers (Panthera tigris amoyensis) isoliert wurde. Der untersuchte Bakterienstamm weist in den morphologischen und chemotaxonomischen Merkmalen Unterschiede zu den bisher beschriebenen Gattungen auf, so dass er als neue Spezies in einer neuen Gattung eingeordnet wurde. Als Folge dieser Untersuchungen wurde die 2011 beschriebene Bakterienart Yaniella fodinae nun als Enteractinococcus fodinae ebenfalls dieser neuen Gattung zugeordnet.<ref name="IJSEM_62_2710" />

2016 wurde die Gattung Arthrobacter im Hinblick auf chemotaxonomische und phylogenetische Merkmale überprüft. Als Ergebnis wurde mehr als 30 Arten in andere, neu beschriebene Gattungen überführt, die als Glutamicibacter, Paeniglutamicibacter, Pseudoglutamicibacter, Paenarthrobacter und Pseudarthrobacter bezeichnet wurden.<ref name="IJSEM_66_9" />

Aktuelle Systematik

Skriptfehler: Ein solches Modul „Vorlage:Anker“ ist nicht vorhanden. Das Phylum der „Actinobacteria“ enthält derzeit (Stand 2018) die gleichnamige Klasse mit mehreren Ordnungen, u. a. die Actinomycetales und die Micrococcales. In der Ordnung Micrococcales gibt es mehrere Familien, wobei die Dermacoccaceae, Intrasporangiaceae, Microbacteriaceae und Micrococcaceae jeweils mehr als 10 Gattungen beinhalten. Zu der Familie Micrococcaceae gehören die folgenden Gattungen (Stand 2018).<ref name="lpsn_phylum" /> Die Angabe von Arten beschränkt sich auf eine Auswahl, wobei in jedem Fall die Typusart der Gattung genannt ist.

Klasse Actinomycetes <templatestyles src="Person/styles.css" />Krassilnikov 1949 [Actinobacteria <templatestyles src="Person/styles.css" />Stackebrandt et al. 1997]

  • Familie Micrococcaceae
  • Genus Acaricomes <templatestyles src="Person/styles.css" />Pukall et al. 2006
  • Genus Arthrobacter <templatestyles src="Person/styles.css" />Conn & Dimmick 1947
  • Arthrobacter agilis (<templatestyles src="Person/styles.css" />Ali-Cohen 1889) <templatestyles src="Person/styles.css" />Koch et al. 1995 [früher Micrococcus agilis]
  • Genus Auritidibacter <templatestyles src="Person/styles.css" />Yassin et al. 2011
  • Genus Citricoccus <templatestyles src="Person/styles.css" />Altenburger et al. 2002 emend. <templatestyles src="Person/styles.css" />Nielsen et al. 2011
  • Enteractinococcus coprophilus <templatestyles src="Person/styles.css" />Cao et al. 2012 (Typusart)
  • Enteractinococcus fodinae (<templatestyles src="Person/styles.css" />Dhanjal et al. 2011) <templatestyles src="Person/styles.css" />Cao et al. 2012 [früher Yaniella fodinae]
  • Genus Garicola <templatestyles src="Person/styles.css" />Lo et al. 2015
  • Genus Kocuria <templatestyles src="Person/styles.css" />Stackebrandt et al. 1995
  • Kocuria aegyptia <templatestyles src="Person/styles.css" />Li et al. 2006
  • Kocuria arsenatis <templatestyles src="Person/styles.css" />Roman-Ponce et al. 2016
  • Kocuria atrinae <templatestyles src="Person/styles.css" />Park et al. 2010
  • Kocuria carniphila <templatestyles src="Person/styles.css" />Tvrzová et al. 2005
  • Kocuria dechangensis <templatestyles src="Person/styles.css" />Wang et al. 2015
  • Kocuria flava <templatestyles src="Person/styles.css" />Zhou et al. 2008
  • Kocuria gwangalliensis <templatestyles src="Person/styles.css" />Seo et al. 2009
  • Kocuria halotolerans <templatestyles src="Person/styles.css" />Tang et al. 2009
  • Kocuria himachalensis Mayilraj et al. 2006
  • Kocuria indica Dastager et al. 2014
  • Kocuria koreensis <templatestyles src="Person/styles.css" />Park et al. 2010
  • Kocuria kristinae (<templatestyles src="Person/styles.css" />Kloos et al. 1974) <templatestyles src="Person/styles.css" />Stackebrandt et al. 1995 [früher Micrococcus kristinae]
  • Kocuria marina <templatestyles src="Person/styles.css" />Kim et al. 2004
  • Kocuria oceani <templatestyles src="Person/styles.css" />Zhang et al. 2017
  • Kocuria palustris <templatestyles src="Person/styles.css" />Kovács et al. 1999
  • Kocuria pelophila <templatestyles src="Person/styles.css" />Hamada et al. 2016
  • Kocuria polaris <templatestyles src="Person/styles.css" />Reddy et al. 2003
  • Kocuria rhizophila <templatestyles src="Person/styles.css" />Kovács et al. 1999
  • Kocuria rosea (<templatestyles src="Person/styles.css" />Flügge 1886) <templatestyles src="Person/styles.css" />Stackebrandt et al. 1995 [früher Micrococcus roseus] (Typusart)
  • Kocuria salsicia <templatestyles src="Person/styles.css" />Yun et al. 2011
  • Kocuria subflava <templatestyles src="Person/styles.css" />Jiang et al. 2016
  • Kocuria turfanensis <templatestyles src="Person/styles.css" />Zhou et al. 2008
  • Kocuria varians (<templatestyles src="Person/styles.css" />Migula 1900) <templatestyles src="Person/styles.css" />Stackebrandt et al. 1995 [früher Micrococcus varians]
  • Kokuria sp. T160-2<ref name="Pylkkö2024"/>
  • Genus Micrococcus <templatestyles src="Person/styles.css" />Cohn 1872 (Approved Lists 1980) emend. <templatestyles src="Person/styles.css" />Wieser et al. 2002
  • Micrococcus aloeverae <templatestyles src="Person/styles.css" />Prakash et al. 2014
  • Micrococcus antarcticus <templatestyles src="Person/styles.css" />Liu et al. 2000
  • Micrococcus cohnii <templatestyles src="Person/styles.css" />Rieser et al. 2013
  • Micrococcus endophyticus <templatestyles src="Person/styles.css" />Chen et al. 2009
  • Micrococcus flavus <templatestyles src="Person/styles.css" />Liu et al. 2007
  • Micrococcus luteus <templatestyles src="Person/styles.css" />(Schroeter 1872) Cohn 1872 (Approved Lists 1980) emend. <templatestyles src="Person/styles.css" />Wieser et al. 2002 (Typusart)
  • Micrococcus lylae <templatestyles src="Person/styles.css" />Kloos et al. 1974 (Approved Lists 1980) emend. <templatestyles src="Person/styles.css" />Wieser et al. 2002
  • Micrococcus terreus <templatestyles src="Person/styles.css" />Zhang et al. 2010
  • Micrococcus yunnanensis <templatestyles src="Person/styles.css" />Zhao et al. 2009
  • Genus Nesterenkonia <templatestyles src="Person/styles.css" />Stackebrandt et al. 1995 emend. <templatestyles src="Person/styles.css" />Li et al. 2005
  • Genus Renibacterium <templatestyles src="Person/styles.css" />Sanders & Fryer 1980
  • Genus Rothia <templatestyles src="Person/styles.css" />Georg & Brown 1967
  • Rothia aeria <templatestyles src="Person/styles.css" />Li et al. 2004
  • Rothia aerolata <templatestyles src="Person/styles.css" />Kämpfer et al. 2016
  • Rothia amarae <templatestyles src="Person/styles.css" />Fan et al. 2002
  • Rothia dentocariosa (<templatestyles src="Person/styles.css" />Onishi 1949) <templatestyles src="Person/styles.css" />Georg & Brown 1967 (Approved Lists 1980) emend. <templatestyles src="Person/styles.css" />Daneshvar et al. 2004 (Typusart)
  • Rothia endophytica <templatestyles src="Person/styles.css" />Xiong et al. 2013
  • Rothia mucilaginosa <templatestyles src="Person/styles.css" />(Bergan & Kocur 1982) Collins et al. 2000 [früher Stomatococcus mucilaginosus bzw. Micrococcus mucilaginosus]
  • Rothia nasimurium <templatestyles src="Person/styles.css" />Collins et al. 2000
  • Rothia terrae <templatestyles src="Person/styles.css" />Chou et al. 2008
  • Genus Sinomonas <templatestyles src="Person/styles.css" />Zhou et al. 2009 emend. <templatestyles src="Person/styles.css" />Zhou et al. 2012
  • Sinomonas atrocyanea (<templatestyles src="Person/styles.css" />Kuhn & Starr 1960) <templatestyles src="Person/styles.css" />Zhou et al. 2009 [früher Arthrobacter atrocyaneus]
  • Sinomonas flava <templatestyles src="Person/styles.css" />Zhou et al. 2009 (Typusart)
  • Sinomonas soli <templatestyles src="Person/styles.css" />Zhou et al. 2012
  • Genus Tersicoccus <templatestyles src="Person/styles.css" />Vaishampayan et al. 2013
  • Genus Yaniella <templatestyles src="Person/styles.css" />Li et al. 2008
  • Yaniella flava (<templatestyles src="Person/styles.css" />Li et al. 2005) <templatestyles src="Person/styles.css" />Li et al. 2008
  • Yaniella halotolerans (<templatestyles src="Person/styles.css" />Li et al. 2004) <templatestyles src="Person/styles.css" />Li et al. 2008 (Typusart)
  • Yaniella soli <templatestyles src="Person/styles.css" />Chen et al. 2012
  • Genus Zhihengliuella <templatestyles src="Person/styles.css" />Zhang et al. 2007 emend. Hamada et al. 2013

Quellen

Literatur

  • Martin Dworkin, Stanley Falkow, Eugene Rosenberg, Karl-Heinz Schleifer, Erko Stackebrandt (Hrsg.): The Prokaryotes, 3. Auflage, Bd. 3: Archaea. Bacteria: Firmicutes, Actinomycetes. Springer Verlag, New York 2006, ISBN 978-0-387-25493-7 (Print), ISBN 978-0-387-30743-5 (Online)
  • Karsten Becker: "Mikrokokken" – Mikrobiologie und Bedeutung. Der Mikrobiologe 2011 21(2): 43–51

Einzelnachweise

<references> <ref name="GEMOLL"> Wilhelm Gemoll: Griechisch-Deutsches Schul- und Handwörterbuch. München/Wien 1965. </ref> <ref name="lpsn_phylum"> Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Phylum „Actinobacteria“. In: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Abgerufen am 7. April 2018. </ref> <ref name="lpsn_familia"> Jean Euzéby, Aidan C. Parte: Familia Micrococcaceae. In: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Abgerufen am 7. April 2018. </ref> <ref name="taxo1"> Taxonomy Browser Micrococcaceae (Familie). In: Webseite des National Center for Biotechnology Information (NCBI). Abgerufen am 7. April 2018. </ref> <ref name="taxo3"> Taxonomy Browser Dermacoccaceae (Familie). In: Webseite des National Center for Biotechnology Information (NCBI). Abgerufen am 7. April 2018. </ref> <ref name="IJSEM_66_9"> Hans-Jürgen Busse: Review of the taxonomy of the genus Arthrobacter, emendation of the genus Arthrobacter sensu lato, proposal to reclassify selected species of the genus Arthrobacter in the novel genera Glutamicibacter gen. nov., Paeniglutamicibacter gen. nov., Pseudoglutamicibacter gen. nov., Paenarthrobacter gen. nov. and Pseudarthrobacter gen. nov., and emended description of Arthrobacter roseus. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 66, Januar 2016, S. 9–37, ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijsem.0.000702 (englisch). </ref> <ref name="IJSEM_62_2710"> Y. R. Cao, Y. Jiang u. a.: Enteractinococcus coprophilus gen. nov., sp. nov., of the family Micrococcaceae, isolated from Panthera tigris amoyensis faeces, and transfer of Yaniella fodinae Dhanjal et al. 2011 to the genus Enteractinococcus as Enteractinococcus fodinae comb. nov. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 62, November 2012, S. 2710–2716, ISSN 1466-5034. doi:10.1099/ijs.0.034249-0. PMID 22228667 (englisch). </ref> <ref name="IJSEM_55_1933"> W. J. Li, P. Schumann u. a.: Proposal of Yaniaceae fam. nov. and Yania flava sp. nov. and emended description of the genus Yania. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 55, September 2005, S. 1933–1938, ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijs.0.63594-0. PMID 16166690 (englisch). </ref> <ref name="IJSEM_58_525"> W. J. Li, X. Y. Zhi, J. P. Euzéby: Proposal of Yaniellaceae fam. nov., Yaniella gen. nov. and Sinobaca gen. nov. as replacements for the illegitimate prokaryotic names Yaniaceae Li et al. 2005, Yania Li et al. 2004, emend Li et al. 2005, and Sinococcus Li et al. 2006, respectively. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 58, Februar 2008, S. 525–527, ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijs.0.65792-0. PMID 18218962 (englisch). </ref> <ref name="brock"> Michael T. Madigan, John M. Martinko, Jack Parker: Brock Mikrobiologie. Deutsche Übersetzung herausgegeben von Werner Goebel, 1. Auflage. Spektrum Akademischer Verlag GmbH, Heidelberg/Berlin 2000, ISBN 978-3-8274-0566-1. </ref> <ref name="Pylkkö2024"> Tuomas Pylkkö, Yannik Karl-Heinz Schneider, Teppo Rämä, Jeanette Hammer Andersen, Päivi Tammela: Bioprospecting of inhibitors of EPEC virulence from metabolites of marine actinobacteria from the Arctic Sea. In: Frontiers in Microbiology, Sec. Antimicrobials, Resistance and Chemotherapy, Band 15, 30. August 2024; doi:10.3389/fmicb.2024.1432475 (englisch). Dazu:

</ref> <ref name="IJSEM_45_4"> E. Stackebrandt, C. Koch, O. Gvozdiak, P. Schumann: Taxonomic dissection of the genus Micrococcus: Kocuria gen. nov., Nesterenkonia gen. nov., Kytococcus gen. nov., Dermacoccus gen. nov., and Micrococcus Cohn 1872 gen. emend. In: International Journal of Systematic Bacteriology. Band 45, Nummer 4, Oktober 1995, S. 682–692, ISSN 0020-7713. PMID 7547287. </ref> <ref name="IJSEM_59_589"> Xiao-Yang Zhi, Wen-Jun Li, Erko Stackebrandt: An update of the structure and 16S rRNA gene sequence-based definition of higher ranks of the class Actinobacteria, with the proposal of two new suborders and four new families and emended descriptions of the existing higher taxa. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Band 59, März 2009, S. 589–608, ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijs.0.65780-0, PMID 19244447. </ref> </references>

Weblinks

Commons: Micrococcaceae (Mikrokokken) – Sammlung von Bildern, Videos und Audiodateien

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