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Thermus thermophilus

aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie

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Veraltete systematische Gruppe

Das hier behandelte Taxon ist nicht Teil der in der deutschsprachigen Wikipedia dargestellten Systematik. Näheres hierzu findet sich im Artikeltext.

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Zeitliches Auftreten

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Fundorte

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Systematik
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(ex Oshima & Imahori, 1974) Manaia et al., 1995}}
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Thermus thermophilus ist eine Spezies gramnegativer Eubakterium aus dem Phylum (Abteilung) Deinococcus-Thermus und wird in vielen biotechnologischen Prozessen verwendet. Das optimale Wachstum liegt bei 49 bis 72 °C, das Bakterium ist somit sehr thermophil. Thermus thermophilus wurde 1974 in heißen Quellen auf der Izu-Halbinsel in Japan gefunden und ist in mehrere Subtypen oder Stämme untergliedert. Am häufigsten befasst man sich mit den Subtypen HB8 (Referenzstamm) und HB27, deren Genom 2004 entschlüsselt wurde.<ref name="Henne2004" />

Aus Thermus thermophilus wird eine für die Polymerase-Kettenreaktion relevante thermostabile Polymerase (Tth) gewonnen. Sie katalysiert mit optimaler Aktivität bei 70 bis 80 °C. Das Enzym benötigt zweiwertige Ionen.

Forschungsgeschichte

Datei:Mine hot spring 01.JPG
Geysirausbruch an der heißen Quelle Mine Onsen
Datei:Mine Onsen in Ealry Showa era.jpg
Mine Onsen, Aufnahme zw. 1926 und 1945

Die Erforschung biologischer Organismen in heißen Quellen begann in den 1960er Jahren. Anfangs dachte man, dass thermophile Bakterien (und Archaeen, aber diese Unterscheidung gab es damals noch nicht) bei Temperaturen von über 55 °C nicht überleben könnten.<ref name="Beock1994"/> Man entdeckte jedoch bald, dass viele Bakterien in verschiedenen dieser heißen Quellen selbst bei höheren Temperaturen nicht nur überleben, sondern sogar wachsen und gediehen. 1969 isolierten Thomas D. Brock und Hudson Freeze von der Indiana University aus der Mushroom Spring im Yellowstone-Nationalpark einen solch extrem thermophilen Bakterianstamm, den sie als Thermus aquaticus YT-1 bezeichneten. Er war der erste Vertreter der Gattung Thermus.<ref name="Brock1969"/><ref name="DSMZ_YT-1"/> seitdem wurden weitere Spezies und Stämme dieser Gattung Thermus in ähnlichen Umgebungen auf der ganzen Welt gefunden;<ref name="Bryan2008"/> u. a. der Stamm T. thermophilus HB8 (ursprünglich der als Stamm einer Spezies Flavobacterium thermophilum beschrieben,<ref name="Yoshida1971"/> ab 1974 zu Gattung Thermus verschoben).<ref name="LPSN_Tth"/> Dieser wurde im September 1968 von Tairo Oshima aus Proben von einer heißen Quelle Mine Onsen (alias Mine Hot Spring)<ref name="MineOnsen"/> auf der Izu-Halbinsel (Japan) isoliert (Yoshida & Oshima, 1971).<ref name="Yoshida1971"/><ref name="NCBI_HB8"/><ref name="BacDive_HB8"/> Die thermostabilen DNA-Polymerasen von Stämmen der Spezies T. aquaticus (Taq-Polymerasen) und T. thermophilus (Tth-Polymerasen) finden heute Verwendung für die Polymerase-Kettenreaktion ({{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=en|SCRIPTING=Latn|SERVICE=englisch}}), neben anderen DNA-Polymerasen, aber inzwischen auch solche aus thermophilen Archaeen.<ref name="SdW_LdB_Thermus"/><ref name="SdW_LdB_Taq-Polymerase"/>

Viren

Thermus thermophilus wird (u. a.) von den zwei nahe verwandten Viren (Bakteriophagen) parasitiert:

  • Thermus-Phage P23-45, Spezies: Thermus-Virus P23-45 (wiss. Oshimavirus P2345)<ref name="Yu2006"/><ref name="Minakhin2008"/><ref name="NCBI_P23-45"/>
  • Thermus-Phage P74-26, Spezies: Thermus-Virus P74-26 (wiss. Oshimavirus P7426)<ref name="Yu2006"/><ref name="Minakhin2008"/><ref name="NCBI_P74-26"/>

Beide Viren sind thermophil, d. h. – wie ihre Wirte – hitzeliebend. Sie gehören zur Gattung Oshimavirus (früher P23virus) und sind vom Morphotyp der Siphoviren, was sie als Mitglieder der Klasse Caudoviricetes (Caudoviren: Viren mit Kopf-Schwanz-Aufbau) kennzeichnet. Ihr ursprünglicher Fundort ist, wie 2006 von M. X. Yu, Michael R. Slater und Hans-Wolfgang Ackermann berichtet, der Vulkan Uson auf Kamtschatka (Doline).<ref name="Yu2006"/><ref name="Minakhin2008"/> P74-26 hat unter den Siphoviren (und damit unter allen Viren) mit fast einem Mikrometer den längsten „Schwanz“ (üblich sind bei Siphoviren 50 bis 1.200 Nanometer) und wird daher auch „Rapunzel-Virus“ genannt. Diese Beobachtung ist umso bemerkenswerter, weil der biegsame „Schwanz“ bei den im Habitat der Viren und ihrer Wirte möglichen Temperaturen von über 76 °C noch thermisch stabil ist.<ref name="Hilbert2017"/><ref name="Stone2018"/><ref name="Agnello2023"/>

Weiterführende Literatur

  • Naoki A. Uemura, Naoya Chiba, Ryota Morikawa, Masatada Tamakoshi, Daisuke Nakane. Rapid water flow triggers long-distance positive rheotaxis for thermophilic bacteria Open Access. In: The ISME Journal, 1. August 2025, wraf164; {{#invoke:Vorlage:Handle|f|scheme=doi|class=plainlinks|parProblem=Problem|errCat=Wikipedia:Vorlagenfehler/Parameter:DOI|errClasses=error editoronly|errHide=1|errNS=0 4 10 100}} ({{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=en|SCRIPTING=Latn|SERVICE=englisch}}). Dazu:

Weblinks

{{#invoke:Vorlage:Anker|f |errCat=Wikipedia:Vorlagenfehler/Vorlage:Anker |errHide=1}}Einzelnachweise

<references> <ref name="NCBI_P23-45"> NCBI: Thermus phage P23-45, heterotypic synonym: Thermus thermophilus phage P23-45,… </ref> <ref name="NCBI_P74-26"> NCBI: Thermus phage P74-26, heterotypic synonym: Thermus thermophilus phage P74-26,… </ref> <ref name="NCBI_HB8"> NCBI Taxonomy Browser: Thermus thermophilus HB8 (strain), heterotypic synonym: Thermus thermophilus ATCC 27634. Dazu:

</ref> <ref name="LPSN_Tth"> LPSN: Species Thermus thermophilus.</ref> <ref name="DSMZ_YT-1"> DSMZ: DSMZ Thermus aquaticus YT-1. </ref> <ref name="BacDive_HB8"> BacDive: Thermus thermophilus HB8 is a thermophilic bacterium that was isolated from hot spring. Auf dsmz.de; Memento im Webarchiv vom 19. März 2023. </ref> <ref name="Beock1994"> Thomas D. Brock: Life at High Temperatures. University of Wisconsin, Department of Bacteriology (bact.wisc.edu), Bioinfo-Server. Essay von 1994. </ref> <ref name="SdW_LdB_Thermus"> Thermus. Lexikon der Biologie auf spektrum.de, 1999. </ref> <ref name="SdW_LdB_Taq-Polymerase"> Taq-DNA-Polymerase. Lexikon der Biologie auf spektrum.de, 1999. </ref> <ref name="MineOnsen"> Mine Onsen Daifunto Park: Hot Spring / Hot Spring Bath. Auf: Japantravel. </ref> <ref name="Agnello2023"> Emily Agnello, Joshua Pajak, Xingchen Liu, Brian A. Kelch: Conformational dynamics control assembly of an extremely long bacteriophage tail tube. In: Journal of Biological Chemistry, Band 299, Nr. 3, 103021, März 2023; doi:10.1016/j.jbc.2023.103021. Dazu:

</ref> <ref name="Brock1969"> Thomas D. Brock, Hudson Freeze: Thermus aquaticus gen. n. and sp. n., a Nonsporulating Extreme Thermophile. In: ASM Journals: Journal of Bacteriology, Band 98, Nr. 1, 1. April 1969; doi:10.1128/jb.98.1.289-297.1969, PMID 5781580, }} PMC 249935 (freier Volltext{{#if:|, PDF}}), PDF. </ref> <ref name="Bryan2008"> {{#invoke:Vorlage:Literatur|f}}{{#if: | {{#if: Vorlage:Cite book/ParamBool | Vorlage:Toter Link/archivebot | Vorlage:Webarchiv/archiv-bot }}

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</ref> <ref name="Henne2004"> A. Henne et al. (2004): The genome sequence of the extreme thermophile Thermus thermophilus. In: Nat Biotechnol., Band 22, Nr. 5, S. 547–553; PMID 15064768. </ref> <ref name="Hilbert2017"> Brendan J. Hilbert, Janelle A. Hayes, Nicholas P. Stone, Rui-Gang Xu, Brian A. Kelch: The large terminase DNA packaging motor grips DNA with its ATPase domain for cleavage by the flexible nuclease domain. In: Nucleic Acids Research. Band 45. Nr. 6, 7. April 2017, S. 3591​–3605; doi:10.1093/nar/gkw1356, PMID 28082398, }} PMC 5389665 (freier Volltext{{#if:|, PDF}}), Epub: 13. Januar 2017. </ref> <ref name="Minakhin2008"> Leonid Minakhin, Manisha Goel, Zhanna Berdygulova, Erlan Ramanculov, Laurence Florens, Galina Glazko, Valeri N. Karamychev, Alexei I. Slesarev, Sergei A. Kozyavkin, Igor Khromov, Hans-Wolfgang Ackermann, Michael Washburn, Arcady Mushegian, Konstantin Severinov: Genome Comparison and Proteomic Characterization of Thermus thermophilus Bacteriophages P23-45 and P74-26: Siphoviruses with Triplex-forming Sequences and the Longest Known Tails. In: Journal of Molecular Biology (jmb), Band 378, Nr. 2, 25. April 2008, S. 468-480; doi:10.1016/j.jmb.2008.02.018. </ref> <ref name="Stone2018"> Nicholas P. Stone, Brendan J. Hilbert, Daniel Hidalgo, Kevin T. Halloran, Jooyoung Lee, Erik J. Sontheimer, Brian A. Kelch: A Hyperthermophilic Phage Decoration Protein Suggests Common Evolutionary Origin with Herpesvirus Triplex Proteins and an Anti-CRISPR Protein. In: Structure, Band 26, Nr. 7, 3. Juli 2018; doi:10.1016/j.str.2018.04.008, PMID 29779790, }} PMC 6277972 (freier Volltext{{#if:|, PDF}}), Epub 17. Mai 2018. </ref> <ref name="Yoshida1971"> Masasuke Yoshida, Tairo Oshima: The thermostable allosteric nature of fructose 1,6-diphosphatase from an extreme thermophile. In: Biochemical and Biophysical Research Communications, Band 45, Nr. 2, 15. Oktober 1971, S. 495-500; doi:10.1016/0006-291X(71)90846-1, PMID 4334342. </ref> <ref name="Yu2006"> M. X. Yu, Michael R. Slater, Hans-Wolfgang Ackermann: Isolation and characterization of Thermus bacteriophages. In: Archives of Virology, Band 151, S. 663–679, April 2006; doi:10.1007/s00705-005-0667-x, PMID 16308675, PDF, Epub 28. November 2005. Siehe insbes. Tbl. 2.: Main characteristics and origin of phages. </ref> </references>