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Kobuvirus

aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie

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Kurzbezeichnung

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Links
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Die Gattung Kobuvirus umfasst mit Stand November 2018 sechs Spezies von unbehüllten Viren aus der Familie Picornaviridae. Der Gattungsname entstammt dem japanischen Wort kobu („Knöchel“), um damit die charakteristischen Oberflächenstrukturen dieser Viren zu beschreiben.

Eigenschaften

Datei:Kobuvirus genome image.svg
Genomkarte der Gattung Kobuvirus

Die Spezies der Gattung Kobuvirus unterscheiden sich von anderen Mitgliedern der Picornaviridae durch einen sehr langen poly-A-Schwanz von 270 nt und einen sehr hohen Anteil der Nukleotide Guanin und Cytosin (G/C-Anteil) von 59 %. Alle Spezies besitzen am {{#if:trim|5'-Ende}} ihres RNA-Genoms eine Haarnadelstruktur, die für die virale Replikation<ref>S. Nagashima, J. Sasaki, K. Taniguchi: The 5'-terminal region of the Aichi virus genome encodes cis-acting replication elements required for positive- and negative-strand RNA synthesis. J Virol. (2005) 79(11): S. 6918–6931, PMID 15890931.</ref> und die Verpackung<ref>J. Sasaki, K. Taniguchi: The 5'-end sequence of the genome of Aichi virus, a picornavirus, contains an element critical for viral RNA encapsidation. J Virology (2003) 77(6): S. 3542–3548, PMID 12610129.</ref> des Genoms von Bedeutung ist. Sehr typisch für Kobuviren ist ihre auffällige Struktur bei der Darstellung im Elektronenmikroskop. Im Gegensatz zu anderen Picornaviren ist die ikosaedrische Symmetrie des Kapsids auch in der äußeren Form deutlich zu erkennen. Die Kobuviren haben einen Durchmesser von 27 bis 30 nm.

Das Aichivirus A (früher Aichi-Virus) wird beim Menschen mit einer viralen Gastroenteritis nach dem Genuss von Krebstieren in Verbindung gebracht.<ref>T. Yamashita, M. Sugiyama et al.: Application of a reverse transcription-PCR for identification and differentiation of Aichi virus, a new member of the Picornavirus family associated with gastroenteritis in humans. J Clin Microbiol. (2000) 38(8): S. 2955–2961, PMID 10921958.</ref>

Systematik

Die innere Systematik der Gattung ist nach ICTV mit Stand November 2018,<ref>ICTV: <templatestyles src="Webarchiv/styles.css" />{{#if:20190314023833 

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  }} MSL including all taxa updates since the 2017 release. Fall 2018 (MSL #33).</ref> ergänzt um Akronyme nach ViralZone (Stand 2016)<ref name="MSL#31acr">ViralZone: ICTV 2016 Master Species List #31 with Acronyms, (Excel XLSX), ViralZone, SIB Swiss Institute of Bioinformatics.</ref> und Serotypen nach den ‚Picorornavirus Pages` des Pirbright Institute<ref name="TBIKobu"><templatestyles src="Webarchiv/styles.css" />{{#if:20190219015743
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             | {{#if:  || }}Vorlage:Webarchiv/Wartung/Parameter{{#invoke:TemplUtl|failure| Fehler bei Vorlage:Webarchiv: Der Wert des Parameter 'archiv-datum' ist ungültig oder hat ein ungültiges Format.|1}}
          |  }} 
         | {{#if:  || }}Vorlage:Webarchiv/Wartung/Parameter{{#invoke:TemplUtl|failure| Fehler bei Vorlage:Webarchiv: Der Pflichtparameter 'archiv-datum' wurde nicht angegeben.|1}}
      }}
    | {{#if: 
         | {{#if:  || }}Vorlage:Webarchiv/Wartung/Parameter{{#invoke:TemplUtl|failure| Fehler bei Vorlage:Webarchiv: Der Parameter 'archiv-datum' ist nur in Verbindung mit 'archiv-url' angebbar.|1}}
      }}
  }}{{#if:{{#invoke:URLutil|isHostPathResource|http://www.picornaviridae.com/kobuvirus/kobuvirus.htm}}
    || {{#if:  || }}
  }}{{#if: Kobuvirus
    | {{#if: {{#invoke:WLink|isBracketedLink|Kobuvirus}}
        | {{#if:  || }}
      }}
    | {{#if:  || }}Vorlage:Webarchiv/Wartung/Linktext_fehlt
  }}{{#switch: 
    |addlarchives|addlpages= {{#if:  || }}{{#if: 1 |Vorlage:Webarchiv/Wartung/Parameter}}{{#invoke:TemplUtl|failure| Fehler bei Vorlage:Webarchiv: enWP-Wert im Parameter 'format'.|1}}
  }}{{#ifeq: {{#invoke:Str|find|http://www.picornaviridae.com/kobuvirus/kobuvirus.htm%7Carchiv}} |-1
    || {{#ifeq: {{#invoke:Str|find|{{#invoke:Str|cropleft|http://www.picornaviridae.com/kobuvirus/kobuvirus.htm%7C4}}%7Chttp}} |-1
         || {{#switch: {{#invoke:Webarchiv|getdomain|http://www.picornaviridae.com/kobuvirus/kobuvirus.htm }}
              | abendblatt.de | daserste.ndr.de | inarchive.com | webcitation.org = 
              | #default = {{#if:  || }}{{#if: 1 |Vorlage:Webarchiv/Wartung/URL}}{{#invoke:TemplUtl|failure| Fehler bei Vorlage:Webarchiv: Archiv-URL im Parameter 'url' anstatt URL der Originalquelle. Entferne den vor der Original-URL stehenden Mementobestandteil und setze den Archivierungszeitstempel in den Parameter 'wayback', 'webciteID', 'archive.today' oder 'archive-is' ein, sofern nicht bereits befüllt.|1}}
            }} 
       }}
  }}, The Picornavirus Pages 2006–2019, The Pirbright Institute, UK. Abgerufen am 18. Februar 2019.</ref> wie folgt:
  • Genus Kobuvirus
  • Spezies Aichivirus A (AiV-A), ehemals Aichi-Virus (AiV), Typusspezies
  • Aichivirus 1 (en. Aichi virus 1, AiV-1)
  • Felines Kobuvirus 1 (en. Feline kobuvirus 1, FeKV, FEKV-1)
  • Canines Kobuvirus 1 (en. Canine kobuvirus 1, CaKV, CaKV-1)
  • Murines Kobuvirus 1 (en. Murine kobuvirus 1, MKV, MKV-1)
  • Blauracken-Kobuvirus 1 (en. European roller kobuvirus 1, alias Roller kobuvirus, RKV<ref name="RBKV" />, RKV-1)
  • Kathmandu-Abwasser-Kobuvirus (en. Kathmandu sewage kobuvirus)
  • Spezies Aichivirus B (AiV-B), ehemals Bovines Kobuvirus (BKV<ref name="RBKV">Akronym nicht eindeutig!</ref>)
  • Bovines Kobuvirus 1 (en. Bovine kobuvirus 1, BKV-1)
  • Frettchen-Kobuvirus 1 (en. Ferret kobuvirus 1, FKV, FKV-1)
  • Schaf-Kobuvirus 1 (alias Ovines Kobuvirus, en. Sheep kobuvirus 1, alias Ovine kobuvirus, OKV, OKV-1)
  • Spezies Aichivirus C (AiV-C), ehemals Porcines Kobuvirus (PKV)
  • Porcines Kobuvirus 1 (en. Porcine kobuvirus 1, PKV-1)
  • Ziegen-Kobuvirus 1 (alias Caprines Kobuvirus 1, en. Caprine kobuvirus 1, CKV, CKV-1)
  • Kagovirus (KV)
  • Kaninchen-Picornavirus (en. Rabbit picornavirus, RKV<ref name="RBKV" />)
  • Fledermaus-Kobuvirus (en. Bat kobuvirus, BKV<ref name="RBKV" />)
  • Keiner Spezies zugeordnete Kobuviren:<ref name="MSL#31acr" />
  • Rinder-Kobuvirus 1 und 2 (en. Cattle kobuvirus 1, 2)

Literatur

  • T. Yamashita, K. Sakae, H. Tsuzuki, Y. Suzuki, N. Ishikawa, N. Takeda, T. Miyamura, S. Yamazaki: Complete nucleotide sequence and genetic organization of Aichi virus, a distinct member of the Picornaviridae associated with acute gastroenteritis in humans. J Virology (1998) 72(10): S. 8408–8412, PMID 9733894 (Erstbeschreibung)
  • G. Stanway, F. Brown et al.: Genus Kobuvirus. In: C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego, 2004, S. 773f
  • T. Yamashita, M. Ito, Y. Kabashima et al.: Isolation and characterization of a new species of kobuvirus associated with cattle. J Gen Virology (2003) 84(Pt 11): S. 3069–3077, PMID 14573811 (frei zugänglicher Artikel mit EM-Bildern)

Einzelnachweise

<references />

Weblinks

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