Zum Inhalt springen

Dicer

aus Wikipedia, der freien Enzyklopädie
{{#if: | {{#if: 2EB1, 4NGB, 4NGC, 4NGD, 4NGF, 4NGG, 4NH3, 4NH5, 4NH6, 4NHA, 4WYQ| {{#if:17098| {{#if: 1912 Aminosäuren | {{#if: | {{#if: | {{#if: | {{#if: | {{#if: DICER1Q9UPY3606241 | {{#if: DICER1 | {{#if: Q9UPY3606241 | {{#if: | {{#if:| {{#if: | {{#if: 3.1.26.-RibonukleaseRNARNA-Stücke mit Länge 21–23 bp | {{#if: 3.1.26.-Ribonuklease| {{#if: | {{#if: | {{#if: | {{#if: RNA| {{#if: RNA-Stücke mit Länge 21–23 bp| {{#if: Kiefermäuler{{#if: Q9UPY3 | {{#ifeq: Dicer | NV ||1}}|}}| {{#if: Q9UPY3 | {{#ifeq: Dicer | NV || | style="background:#C3FDB8; color:#000000;" | Homologie-Familie {{#if: Kiefermäuler | | style="background:#C3FDB8; color:#000000;" | Übergeordnetes Taxon {{#if: | | style="background:#C3FDB8; color:#000000;" | Ausnahmen {{#if: {{#if: Hausmaus | | colspan="3" style="background:#90EE90; color:#202122; text-align:center;" | Orthologe {{#if: ENSG00000100697ENSMUSG00000041415
{{#if: | | Dicer }}
Dicer }}
Dicer-Homolog-Protein aus Giardia intestinalis nach PDB 2FFL
Dicer }}
Andere Namen

{{{Andere Namen}}} }}

Vorhandene Strukturdaten: 2EB1, 4NGB, 4NGC, 4NGD, 4NGF, 4NGG, 4NH3, 4NH5, 4NH6, 4NHA, 4WYQ }}

Eigenschaften des menschlichen Proteins

}}

Masse/Länge Primärstruktur 1912 Aminosäuren

}}

Sekundär- bis Quartärstruktur

}}

Kofaktor

}}

Präkursor

}}

Isoformen

}}

Bezeichner
{{#if: | Gen-Namen | Gen-Name}} | Gen-Name(n) }} {{#if:17098 | DICER1 | DICER1}}{{#if: |, }} }}
Externe IDs

{{#if: |

0 | }} - = – valid|1|2=/^[1-9]%d?%d?%d?%d?%d?%d?%d?%d?$/ 0 | Wikipedia:Vorlagenfehler/Vorlage:PubChem}} template= Vorlage:PubChem format=

}} }}{{#invoke:TemplatePar|check

all= 1= opt= 2= 0 | Wikipedia:Vorlagenfehler/Vorlage:PubChem}} template= Vorlage:PubChem format=

}}{{#if: {{#invoke:Wikidata|pageId}}||{{#ifeq: 0 | 0 | }} }}}}{{#if: | 

 }}

}}

Arzneistoffangaben
ATC-Code 
 }}
 {{#if:|
DrugBank [2] 
 }}
 {{#if:|
Wirkstoffklasse 
 }}

}}

Transporter-Klassifikation
TCDB [3] 
 {{#if: |
Bezeichnung 
 }}

}}

{{#if:|Inhibitorklassifikation|{{#if:|Enzymklassifikationen|Enzymklassifikation}}}}
EC, Kategorie {{#if:3.1.26.-| 3.1.26.-}}{{#if: Ribonuklease|, Ribonuklease}} }}
MEROPS [4]}}
MEROPS {{{Inhibitor_fam}}}}}
Reaktionsart 
 }}
Substrat RNA 
 }}
Produkte RNA-Stücke mit Länge 21–23 bp 
 }}


}}

Vorkommen
{{#if: Dicer|Hovergen}}] Dicer|Hovergen}}]}} }} }}
Kiefermäuler }}
}}

}}

Mensch Hausmaus
Entrez 
 {{ #if: 23405
23405 }} 
 {{ #if: 192119
192119 }}
style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Ensembl 
    {{ #if: ENSG00000100697
ENSG00000100697 }} 
    {{ #if: ENSMUSG00000041415
ENSMUSG00000041415 }}

} 

 |-
 | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | UniProt
 {{ #if: Q9UPY3
    | | {{#if: kurz| | UniProt }} {{#if:|{{{titel}}}|Q9UPY3}}{{#if:|Vorlage:Abrufdatum}}
    | |  }}
 {{ #if: Q8R418
    | | {{#if: kurz| | UniProt }} {{#if:|{{{titel}}}|Q8R418}}{{#if:|Vorlage:Abrufdatum}}
    | |  }}
 |-
 {{#if: NM_001195573NM_148948
    | | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Refseq (mRNA)
      {{ #if: NM_001195573
         | | NM_001195573
         | |  }}
      {{ #if: NM_148948
         | | NM_148948
         | |  }}
    |}}
 |-
 {{#if: NP_001182502NP_683750
    | | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Refseq (Protein)
      {{ #if: NP_001182502
         | | NP_001182502
         | |  }}
      {{ #if: NP_683750
         | | NP_683750
         | |  }}
    |}}
 |-
 {{#if: 14950862289515801012104687742104751952
    | | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Genlocus
      {{#if: 14 
        | {{#if: 95086228 
            | {{#if: 95158010 
                | |  #if: hg38 |?db=hg38|}}&position=chr14:95086228-95158010 Chr 14: {{#expr: 95086228 / 1000000 round 2}} – {{#expr: 95158010 / 1000000 round 2}} Mb 
                | |  }}
            | |  }}
        | |  }}
      {{#if: 12 
        | {{#if: 104687742 
            | {{#if: 104751952 
                | |  #if: mm10 |?db=mm10|}}&position=chr12:104687742-104751952 Chr 12: {{#expr: 104687742 / 1000000 round 2}} – {{#expr: 104751952 / 1000000 round 2}} Mb 
                | |  }}
           | |  }}
       | |  }}
    |}}
 |-
 | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | PubMed-Suche 
 {{ #if: 23405
    | | 23405
    | |  }}
 {{ #if: 192119
    | | 192119
    | |  }}

| |- | colspan="3" style="background:#90EE90; color:#202122; text-align:center;" | Orthologe (Mensch) |- | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Entrez | colspan="2" | 23405 

 {{#if: ENSG00000100697
    | |-

| style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Ensembl | colspan="2" | ENSG00000100697 }} |- | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | UniProt | colspan="2" | {{#if: kurz| | UniProt }} {{#if:|{{{titel}}}|Q9UPY3}}{{#if:|Vorlage:Abrufdatum}} 

 {{#if: NM_001195573
    | |-

| style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Refseq (mRNA) | colspan="2" | NM_001195573 }} 

 {{#if: NP_001182502
    | |-

| style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Refseq (Protein) | colspan="2" | NP_001182502 }} 

 {{#if: 14 
   | {{#if: 95086228 
       | {{#if: 95158010 
           | |-

| style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Genlocus | colspan="2" | #if: hg38 |?db=hg38|}}&position=chr14:95086228-95158010 Chr 14: {{#expr: 95086228 / 1000000 round 2}} – {{#expr: 95158010 / 1000000 round 2}} Mb 

           |  }}
       |  }}
   |  }}

|- | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | PubMed-Suche | colspan="2" | 23405 }} {{#if: Hausmaus 

    | {{#if: 192119ENSMUSG00000041415NM_148948NP_683750mm1012104687742104751952Q8R418 
        |
        |  Spezies2= ist definiert, es sind jedoch keine weiteren Angaben zu Spezies2 vorhanden.{{#ifeq:0|0| }} }}
    | {{#if: 192119ENSMUSG00000041415NM_148948NP_683750mm1012104687742104751952Q8R418 
        |  Es sind Angaben zu Spezies2 vorhanden, Spezies2= ist jedoch nicht definiert.{{#ifeq:0|0| }}
        |}}

}} | {{#if: Hausmaus | | colspan="3" style="background:#90EE90; color:#202122; text-align:center;" | Orthologe 

 |-
 | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" |
 | style="background:#C3FDB8; color:#202122; text-align:center;" | Mensch
 | style="background:#C3FDB8; color:#202122; text-align:center;" | Hausmaus
 |-
 | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Entrez
 {{ #if: 23405
    | | 23405
    | |  }}
 {{ #if: 192119
    | | 192119
    | |  }}
 |-
 {{#if: ENSG00000100697ENSMUSG00000041415
    | | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Ensembl
    {{ #if: ENSG00000100697
       || ENSG00000100697
       ||  }}
    {{ #if: ENSMUSG00000041415
       || ENSMUSG00000041415
       ||  }}
  |}}
 |-
 | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | UniProt
 {{ #if: Q9UPY3
    | | {{#if: kurz| | UniProt }} {{#if:|{{{titel}}}|Q9UPY3}}{{#if:|Vorlage:Abrufdatum}}
    | |  }}
 {{ #if: Q8R418
    | | {{#if: kurz| | UniProt }} {{#if:|{{{titel}}}|Q8R418}}{{#if:|Vorlage:Abrufdatum}}
    | |  }}
 |-
 {{#if: NM_001195573NM_148948
    | | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Refseq (mRNA)
      {{ #if: NM_001195573
         | | NM_001195573
         | |  }}
      {{ #if: NM_148948
         | | NM_148948
         | |  }}
    |}}
 |-
 {{#if: NP_001182502NP_683750
    | | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Refseq (Protein)
      {{ #if: NP_001182502
         | | NP_001182502
         | |  }}
      {{ #if: NP_683750
         | | NP_683750
         | |  }}
    |}}
 |-
 {{#if: 14950862289515801012104687742104751952
    | | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Genlocus
      {{#if: 14 
        | {{#if: 95086228 
            | {{#if: 95158010 
                | |  #if: hg38 |?db=hg38|}}&position=chr14:95086228-95158010 Chr 14: {{#expr: 95086228 / 1000000 round 2}} – {{#expr: 95158010 / 1000000 round 2}} Mb 
                | |  }}
            | |  }}
        | |  }}
      {{#if: 12 
        | {{#if: 104687742 
            | {{#if: 104751952 
                | |  #if: mm10 |?db=mm10|}}&position=chr12:104687742-104751952 Chr 12: {{#expr: 104687742 / 1000000 round 2}} – {{#expr: 104751952 / 1000000 round 2}} Mb 
                | |  }}
           | |  }}
       | |  }}
    |}}
 |-
 | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | PubMed-Suche 
 {{ #if: 23405
    | | 23405
    | |  }}
 {{ #if: 192119
    | | 192119
    | |  }}

| |- | colspan="3" style="background:#90EE90; color:#202122; text-align:center;" | Orthologe (Mensch) |- | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Entrez | colspan="2" | 23405 

 {{#if: ENSG00000100697
    | |-

| style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Ensembl | colspan="2" | ENSG00000100697 }} |- | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | UniProt | colspan="2" | {{#if: kurz| | UniProt }} {{#if:|{{{titel}}}|Q9UPY3}}{{#if:|Vorlage:Abrufdatum}} 

 {{#if: NM_001195573
    | |-

| style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Refseq (mRNA) | colspan="2" | NM_001195573 }} 

 {{#if: NP_001182502
    | |-

| style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Refseq (Protein) | colspan="2" | NP_001182502 }} 

 {{#if: 14 
   | {{#if: 95086228 
       | {{#if: 95158010 
           | |-

| style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | Genlocus | colspan="2" | #if: hg38 |?db=hg38|}}&position=chr14:95086228-95158010 Chr 14: {{#expr: 95086228 / 1000000 round 2}} – {{#expr: 95158010 / 1000000 round 2}} Mb 

           |  }}
       |  }}
   |  }}

|- | style="background:#C3FDB8; color:#202122;" | PubMed-Suche | colspan="2" | 23405 }} {{#if: Hausmaus 

    | {{#if: 192119ENSMUSG00000041415NM_148948NP_683750mm1012104687742104751952Q8R418 
        |
        |  Spezies2= ist definiert, es sind jedoch keine weiteren Angaben zu Spezies2 vorhanden.{{#ifeq:0|0| }} }}
    | {{#if: 192119ENSMUSG00000041415NM_148948NP_683750mm1012104687742104751952Q8R418 
        |  Es sind Angaben zu Spezies2 vorhanden, Spezies2= ist jedoch nicht definiert.{{#ifeq:0|0| }}
        |}}

}} }}

|}{{#if:2ffl-by-domain.png||}}

Dicer [<templatestyles src="IPA/styles.css" />{{#if:|[}}ˈdaɪsɚ{{#if: 

    | ] <phonos file="{{{Tondatei}}}"></phonos>
  }}{{#invoke:TemplatePar|check

|all= 1= |opt= 2= Tondatei= |template=Vorlage:IPA |errNS= 0 |cat=Wikipedia:Vorlagenfehler/Vorlage:IPA |format=@@@ }}] (wörtlich etwa „Würfelschneider“, von engl.: to dice: „in Würfel schneiden“) ist eine Endoribonuklease, die doppelsträngige RNA in kurze, doppelsträngige Fragmente schneidet. Je nach Substrat werden diese Produkte unterschiedlich bezeichnet. Diese Fragmente sind etwa 20 bis 25 Nukleotide lang und spielen bei dem Mechanismus der RNA-Interferenz die zentrale Rolle. Mutationen des DICER1-Gens wurden bei kindlichen Tumoren wie dem Pleuro-pulmonalen Blastom oder seltenen kindlichen Tumoren des zentralen Nervensystems<ref name="DOI10.1007/s00401-019-01997-y">Leanne de Kock, John R. Priest, William D. Foulkes, Sanda Alexandrescu: An update on the central nervous system manifestations of DICER1 syndrome. In: Acta Neuropathologica. doi:10.1007/s00401-019-01997-y.</ref> beschrieben (DICER1-Syndrom)<ref>{{#ifeq:|ID|284343| Eintrag zu {{#if:DICER1-Tumorprädispositionssyndrom|DICER1-Tumorprädispositionssyndrom|Dicer}}. In: Orphanet (Datenbank für seltene Krankheiten)Vorlage:Abrufdatum }}</ref>. Auch Schilddrüsenveränderungen (mehrknotige Struma) kommen in diesem Kontext vor.<ref>L. Doros, K. A. Schultz, D. R. Stewart et al.: ICER1-Related Disorders. 2014 Apr 24. In: M. P. Adam, H. H. Ardinger, R. A. Pagon et al. (Hrsg.): GeneReviews® [Internet]. Seattle (WA): University of Washington. Seattle; 1993–2019. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK196157/</ref>

Dicer ist ein RNase-III-ähnliches Enzym. Es enthält zwei RNase-III-Domänen und eine PAZ-Domäne. Der Abstand zwischen diesen beiden Domänen wird durch einen Helixbereich bestimmt, dessen Länge die Länge der entstehenden siRNAs bestimmt. Dicer katalysiert den ersten Schritt der RNA-Interferenz und initiiert die Bildung des RNA-induced silencing complex (RISC), dessen Endonuklease „argonaute“ in der Lage ist, mRNA abzubauen, deren Sequenz komplementär zu der entstandenen siRNA ist.

Mithilfe von Knockout-Moosen konnte gezeigt werden, dass DCL1b, eines von vier Dicer-Proteinen von Physcomitrella, nicht für die miRNA Biogenese, sondern für das Schneiden der Zieltranskripte notwendig ist. Dies führte zur Aufklärung eines neuen Mechanismus der Genregulation.<ref>{{#invoke:Vorlage:Literatur|f}}</ref>

Der Name Dicer wurde von Emily Bernstein vergeben, einer Doktorandin in der Arbeitsgruppe von Greg Hannon am Cold Spring Harbor Laboratory, die als erste Ribonuklease-Aktivität des Dicers an dsRNA zeigen konnte.

Literatur

  • J. J. Rossi: Mammalian Dicer finds a partner. In: EMBO Rep. Band 6, Nr. 10, Okt 2005, S. 927–929. Review. PMID 16222240

Einzelnachweise

<references />

Abgerufen von „https://wiki-de.moshellshocker.dns64.de/index.php?title=Dicer&oldid=924837“