Chordopoxvirinae

Chordopoxvirinae
Datei:Smallpox virus virions TEM PHIL 1849.JPG Humane Pockenviren (TEM-Abbildung)
Systematik
Klassifikation: Viren Realm: Varidnaviria<ref name="ICTV_MSL#35_VarV">ICTV: ICTV Taxonomy history: Variola virus, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)</ref> Reich: Bamfordvirae<ref name="ICTV_MSL#35_VarV" /> Phylum: Nucleocytoviricota<ref name="ICTV_MSL#35_VarV" /> Klasse: Pokkesviricetes<ref name="ICTV_MSL#35_VarV" /> Ordnung: Chitovirales<ref name="ICTV_MSL#35_VarV" /> Familie: Poxviridae Unterfamilie: Chordopoxvirinae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear Baltimore: Gruppe 1 Symmetrie: komplex Hülle: vorhanden
Wissenschaftlicher Name
Kurzbezeichnung
ChPV
Links
ICTV Taxon History: Vorlage:MakeURLsFromIDs NCBI Taxonomy: Vorlage:MakeURLsFromIDs ViralZone (Expasy, SIB): Vorlage:MakeURLsFromIDs

Die Unterfamilie Chordopoxvirinae fasst acht Gattungen der Familie Poxviridae zusammen, die bei Wirbeltieren (Vertebraten), beispielsweise Säugetieren, Vögeln und Nagetieren, Infektionen verursachen können. Die Unterfamilie wurde geschaffen, um diese Gattungen von den Mitgliedern der Unterfamilie Entomopoxvirinae zu separieren, die nur Pockenviren bei Insekten umfassen. Aufgrund dieser Abtrennung wurde der Name der Gattung nicht nach den Wirbeltieren „Vertebropoxvirinae“ benannt, sondern nach dem Stamm der Chordatiere, obwohl noch keine Pockenviren bei nicht zu den Wirbeltieren gehörenden Chordatieren isoliert wurden. Diese Einteilung nach dem Wirtsspektrum spiegelt sich auch in der phylogenetischen Distanz zwischen Chordo- und Entomopoxvirinae wider.

Zwischen den Gattungen der Chordopoxvirinae wird eine serologische Kreuzreaktivität beobachtet, wobei die Mitglieder der Avipoxviren bei Vögeln diese Eigenschaft weniger aufweisen als die Viren bei Säugetieren. Einige Mitglieder der Chordopoxvirinae verursachen typische Läsionen auf der Chorioallantoismembran, wenn sie in embryonierten Hühnereiern für Laborzwecke angezüchtet werden.

Aufbau und Genom

Die Mitglieder der Chordopoxvirinae stellen sich als ovoide oder Backstein-förmige Virionen dar.

Das lineare, doppelsträngige DNA-Genom besitzt gewöhnlich einen niedrigen GC-Gehalt von 30 bis 40 %, kann aber von 25 bis 67 % variieren. Ein hoher GC-Gehalt liegt bei den Gattungen Parapoxvirus und Crocodylidpoxvirus sowie dem Molluscum-contagiosum-Virus vor.<ref>Eneida L. Hatcher, Chunlin Wang, Elliot J. Lefkowitz: Genome Variability and Gene Content in Chordopoxviruses: Dependence on Microsatellites. In: Viruses, Band 7, Nr. 4, 2015, S. 2126–2146; doi:10.3390/v7042126 (englisch).</ref><ref name=Roychoudhury2011>Vorlage:Cite book/URLVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/Meldung2</ref><ref name="YuLi">Yu Li, Hermann Meyer, Hui Zhao, Inger K. Damon: GC Content-Based Pan-Pox Universal PCR Assays for Poxvirus Detection. In: J Clin Microbiol., Band 48, Nr. 1, Januar 2010, S. 268–276; doi:10.1128/JCM.01697-09, PMC 2812294 (freier Volltext), Epub 11. November 2009 (englisch).</ref>

Das Genom von Molluscum contagiosum virus Subtyp 1 hat einen GC-Gehalt von 63,4 %, das der Parapoxviren Bovine papular stomatitis virus ( BV-AR02) und Orf virus ( OV-SA00) hat 64,5 % respektive 64,3 %.<ref name="YuLi" /> Das Genom des Nile crocodilepox virus hat eine Länge von 190.054 Basenpaaren (bp). Es kodiert vorhergesagt für 173 Proteine bei einem GC-Gehalt von 61,9 % ( Simbabwe).<ref name="NeedhamWorden2019S1">David M. Needham, Alexandra Z. Worden et al.: A distinct lineage of giant viruses brings a rhodopsin photosystem to unicellular marine predators (Memento des Vorlage:IconExternal vom 26. September 2019 im Internet Archive) Datei:Pictogram voting info.svg Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/www.pnas.org, in: PNAS, 23. September 2019, doi:10.1073/pnas.1907517116, ISSN 0027-8424, hier: @1@2Vorlage:Toter Link/www.pnas.orgSupplement 1 (xlsx) (Seite nicht mehr abrufbar, festgestellt im Oktober 2022. Suche im Internet Archive )Vorlage:Toter Link/archivebot</ref><ref name="YuLi" />

Eine stets gleichförmig angeordnete Gruppe von zentralen Genen charakterisiert die Chordopoxvirinae trotz variabler Sequenzen zwischen den Gattungen.

Systematik

Die innere Systematik der Chordopoxvirinae ist nach ICTV, Stand 20. März 2026, wie folgt:<ref name="ICTV_Tax">ICTV: Taxonomy Browser.</ref><ref name="ICTV_VMR">ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).</ref>

• Familie Poxviridae

• Unterfamilie Chordopoxvirinae

• Gattung Avipoxvirus (Vogelpockenviren)
  • Spezies Avipoxvirus canarypox
  • Spezies Avipoxvirus flamingopox
  • Spezies Avipoxvirus fowlpox (früher Avipoxvirus galli, ehem. Typus), mit Fowlpox virus
  • Spezies Avipoxvirus penguinpox
  • Spezies Avipoxvirus pigeonpox
  • Spezies Avipoxvirus quailpox
  • Spezies Avipoxvirus turkeypox
• Gattung Capripoxvirus (Schaf- und Ziegenpockenviren)
  • Spezies Capripoxvirus goatpox (früher Capripoxvirus caprae), mit Goatpox virus
  • Spezies Capripoxvirus lumpyskinpox (früher Capripoxvirus bovis nodularis) mit Dermatitis-nodularis-Virus
  • Spezies Capripoxvirus sheeppox (früher Capripoxvirus ovis, ehem. Typus), mit Sheeppox virus
• Gattung Centapoxvirus
  • Spezies Centapoxvirus microtuspox
  • Spezies Centapoxvirus yokapox(ehem. Typus) mit Yokapox virus (YOKV)
• Gattung Cervidpoxvirus
  • Spezies Cervidpoxvirus muledeerpox mit Mule deerpox virus alias Deerpox-Virus (MDPV)<ref name="Afonso2005"/>
• Gattung Crocodylidpoxvirus (Krokodilpockenviren)
  • Spezies Crocodylidpoxvirus nilecrocodilepox mit Nile crocodilepox virus (Nilkrokodilpockenvirus, CRV)
• Gattung Leporipoxvirus (Hasenpockenviren)<ref name="SIB153"/>
  • Spezies Leporipoxvirus myxoma (früher Leporipoxvirus myxomatosis, ehem. Typus) mit Myxoma virus (Myxomatosevirus, MYXV) → Myxomatose
  • Spezies Leporipoxvirus shope (früher Leporipoxvirus fibromatosis) mit Shope fibroma virus alias Rabbit fibroma virus (Kaninchenfibromvirus, RFV)
  • Spezies Leporipoxvirus squirrelfibroma mit Squirrel fibroma virus (Hörnchenfibromvirus, SFV)
  • Spezies „Hare fibroma virus“<ref name="Kerr2015"/> (Hasenfibromvirus, FIBV)
• Gattung Macropopoxvirus (Kängurupockenvirus)
  • Spezies Macropopoxvirus mfuliginosuspox mit Western kangaroopox virus
  • Spezies Macropopoxvirus mgiganteuspox mit Eastern kangaroopox virus
• Gattung Molluscipoxvirus (Weichtierpockenviren)
  • Spezies: Molluscipoxvirus molluscum mit Molluscum contagiosum virus
• Gattung Mustelpoxvirus
  • Spezies Mustelpoxvirus seaotterpox mit Sea otterpox virus
• Gattung Orthopoxvirus (Echte Pockenviren)
  • Spezies Orthopoxvirus abatinomacacapox mit Orthopoxvirus Abatino
  • Spezies Orthopoxvirus akhmetapox mit Akhmeta-Virus
  • Spezies Orthopoxvirus camelpox mit Kamelpockenvirus
  • Spezies Orthopoxvirus cowpox mit Cowpox-Virus
  • Spezies Orthopoxvirus ectromelia mit Ectromelia-Virus
  • Spezies Orthopoxvirus monkeypox(früher Orthopoxvirus simiae) mit Affenpockenvirus
  • Spezies Orthopoxvirus raccoonpox mit Waschnär-Pockenvirus
  • Spezies Orthopoxvirus skunkpox mit Skunk-Pockenvirus
  • Spezies Orthopoxvirus taterapox mit Taterapox-Virus
  • Spezies Orthopoxvirus vaccinia (ehem. Typus) mit Vaccinia-Virus (Vacciniavirus)
  • Spezies Orthopoxvirus variola (früher Orthopoxvirus variolae) mit Variola-Virus
  • Spezies Orthopoxvirus volepox mit Volepox-Virus
  • Spezies Oryzopoxvirus cotia mit Cotia-Virus
• Gattung Oryzopoxvirus
  • Spezies: Oryzopoxvirus cotia mit Cotia virus
• Gattung Parapoxvirus (Parapockenviren)
  • Spezies Parapoxvirus bovinestomatitis
  • Spezies Parapoxvirus orf (früher Parapoxvirus ovis, ehem. Typus) mit Orf-Virus
  • Spezies Parapoxvirus pseudocowpox
  • Spezies Parapoxvirus reddeerpox
  • Spezies Parapoxvirus sealpox
• Gattung Pteropopoxvirus,
  • Spezies Pteropopoxvirus pteropox mit Pteropox-Virus<ref name="Upton2016"/><ref name="Squirrelweb"/>
• Gattung Salmonpoxvirus,
  • Spezies Salmonpoxvirus gillpox mit
• Gattung Sciuripoxvirus,
  • Spezies Sciuripoxvirus squirrelpox (früher Squirrel parapoxvirus) mit Squirrelpox-Virus alias (Berliner Eichhörnchen-Pockenvirus, BerSQPV), nicht näher verwandt mit dem „Britischen Eichhönchen-Pockenvirus“, „UK SPQV“<ref name="Wibbelt2017"/><ref name="Romeo2012f"/>
• Gattung Suipoxvirus (Schweinepockenviren),<ref>SIB: Suipoxvirus, auf: ViralZone</ref>
  • Spezies Suipoxvirus swinepox (früher Suipoxvirus suis) mit Swinepox-Virus (Schweinepockenvirus, SWPV)
• Gattung Vespertilionpoxvirus,
  • Spezies Vespertilionpoxvirus eptesipox mit Eptesipox-Virus<ref name="Tu2017"/>
• Gattung Yatapoxvirus (Yatapockenviren),<ref>SIB: Yatapoxvirus, auf: ViralZone</ref>
  • Spezies Yatapoxvirus yabapox (ehem. Typus) mit (Yaba-Affentumor-Virus, YMTV)
  • Spezies Yatapoxvirus tanapox mit Tanapox-Virus (Tanapockenvirus), inkl. (YLDV)

Quellen

• R. M. Buller et al.: Subfamily Chordavirinae. In: C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. London, San Diego, 2005, S. 122, ISBN 0-12-249951-4
• B. Moss: Poxviridae: The Viruses and Their Replication. In: David M. Knipe, Peter M. Howley (eds.-in-chief): Fields’ Virology. 5. Auflage, Band 2, Philadelphia 2007, S. 2906ff ISBN 0-7817-6060-7

Einzelnachweise

<references> <ref name="SIB153"> SIB: Leporipoxvirus, auf: ViralZone. </ref> <ref name="Squirrelweb"> Red squirrels in Bangor, North Wales on the increase, auf: SquirrelWeb vom 23. Juli 2018. </ref> <ref name="Afonso2005"> C. L. Afonso, G. Delhon, E. R. Tulman, Z. Lu, A. Zsak, V. M. Becerra, L. Zsak, G. F. Kutish, D. L. Rock: Genome of Deerpox Virus. In: J Virol., Band 79, Nr. 2, Januar 2005, S. 966–977; doi:10.1128/JVI.79.2.966-977.2005, PMC 538591 (freier Volltext), PMID 15613325 (englisch). </ref> <ref name="Kerr2015"> Peter J. Kerr, June Liu, Isabella Cattadori, Elodie Ghedin, Andrew F. Read, Edward C. Holmes: Myxoma Virus and the Leporipoxviruses: An Evolutionary Paradigm. In: MDPI - Viruses, Band 7, Nr. 3, 7. März 2015, S. 1020–1061; doi:10.3390/v7031020, PMID 25757062, PMC 4379559 (freier Volltext), Epub 6. März 2015 (englisch). </ref> <ref name="Upton2016"> Chris Upton, Ginny Emerson, Mark A O’Dea: ICTV Proposal 2016.013aD (PDF; 634 kB). </ref> <ref name="Wibbelt2017"> G. Wibbelt, S. H. Tausch, P. W. Dabrowski, O. Kershaw, A. Nitsche, L Schrick: Berlin squirrelpox virus, a new poxvirus in red squirrels, Berlin, Germany. In: Emerg Infect Dis. Vol. 23, Nr. 10, Oktober 2017, doi:10.3201/eid2310.171008 (englisch). </ref> <ref name="Romeo2012f"> Claudia Romeo: Parasites And Biological Invasions: Alien Grey Squirrel (Sciurus carolinensis) And Native Red Squirrel (S. vulgaris) As Model System. (PDF; 1,7 MB) Università degli studi di Milano, dipartimento di bioscienze, WS 2012/2013. </ref> <ref name="Tu2017"> Shin-Lin Tu, Yoshinori Nakazawa, Jinxin Gao, Kimberly Wilkins, Nadia Gallardo-Romero, Yu Li, Ginny L. Emerson, darin S. Carroll, Chris Upton: Characterization of Eptesipoxvirus, a novel poxvirus from a microchiropteran bat. In: Virus Genes, Dezember 2017, Band 53, Issue 6, S. 856–867; doi:10.1007/s11262-017-1485-4 (englisch).</ref> </references>

Weblinks

• Chordopoxvirinae (NCBI)