Oligonukleotide

Oligonukleotide (von {{#invoke:Vorlage:lang|full |CODE=el |SCRIPTING=Grek |SERVICE={{#if: {{#invoke:TemplUtl|faculty| 0 }} | neu}}griechisch |SUITABLE=prefix neu}}) sind aus wenigen Nukleotiden (DNA oder RNA) aufgebaute Oligomere (mit Suffix -mer von gr. meros ‚Teil‘, ‚Gebiet‘). Man spricht daher beispielsweise bei 25 Nukleotidsequenzen (nt) von einem 25-mer. Ein weiteres Beispiel: Die Haarnadelstruktur des Genoms der Viren des Phylums Cressdnaviricota ({{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=en|SCRIPTING=Latn|SERVICE=englisch}} {{#invoke:Vorlage:lang|flat}}) enthält ein hochkonserviertes Nonanukleotid (9 nt).

Für viele der Anwendungen besteht die Nukleotidsequenz zwischen 15 und 30 Nukleotideinheiten (entsprechend einem 15-mer bis 30-mer).

Eingesetzt werden Oligonukleotide als

• Primer für die Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
• Sonden bei der Real Time Quantitative PCR
• Primer für die DNA-Sequenzierung
• Primer für die cDNA-Synthese
• Primer für das Random Priming
• Bausteine für das Vectordesign
• Bausteine für die künstliche Gensynthese
• Antisense-Oligonukleotide
• Oligonukleotid DNA-Fingerprinting
• Oligonukleotidsonde
• Oligonukleotid-Chip
• Mutagenese-Kassette oder Primer in der Oligonukleotidvermittelten Mutagenese ({{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=en|SCRIPTING=Latn|SERVICE=englisch}})<ref>Laborjournal: Zielgerichtete Mutagenese, {{#if:|{{#iferror: {{#iferror:{{#invoke:Vorlage:FormatDate|Execute}}|}}| |}}}}{{#if:|{{{autor}}}: }}{{#if:|{{#if:Teil I|[{{#invoke:Vorlage:Internetquelle|archivURL|1={{#invoke:URLutil|getNormalized|1={{{archiv-url}}}}}}} {{#invoke:Vorlage:Internetquelle|TitelFormat|titel=Teil I}}]{{#if:| ({{{format}}})}}{{#if:| {{{titelerg}}}{{#invoke:Vorlage:Internetquelle|Endpunkt|titel={{{titelerg}}}}}}}}}|{{#if:https://www.laborjournal.de/rubric/methoden/methoden/m_v62.php%7C{{#if:{{#invoke:TemplUtl%7Cfaculty%7C}}%7C{{#invoke:Vorlage:Internetquelle%7CTitelFormat%7Ctitel={{#invoke:WLink%7CgetEscapedTitle%7C1=Teil I}}}}|[{{#invoke:URLutil|getNormalized|1=https://www.laborjournal.de/rubric/methoden/methoden/m_v62.php}} {{#invoke:Vorlage:Internetquelle|TitelFormat|titel={{#invoke:WLink|getEscapedTitle|1=Teil I}}}}]}}{{#if:| ({{{format}}}{{#if:{{#if: 2020-09-15 | {{#if:{{#invoke:TemplUtl|faculty|}}||1}}}}

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• Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA)

Aptamere (von {{#invoke:Vorlage:lang|full|CODE=la |SCRIPTING=Latn |SERVICE=lateinisch}}) sind Oligonukleotide, die ein spezifisches Molekül über ihre 3D-Struktur binden können. Verschiedene Oligonukleotide werden als Arzneistoffe verwendet.<ref>M. Egli, M. Manoharan: Chemistry, structure and function of approved oligonucleotide therapeutics. In: Nucleic acids research. Band 51, Nummer 6, April 2023, S. 2529–2573, {{#invoke:Vorlage:Handle|f|scheme=doi|class=plainlinks|parProblem=Problem|errCat=Wikipedia:Vorlagenfehler/Parameter:DOI|errClasses=error editoronly|errHide=1|errNS=0 4 10 100}}, PMID 36881759, }} PMC 1008571 (freier Volltext{{#if:|, PDF}}).</ref>

Synthese

Die Oligonukleotide werden nach der Phosphoramidit-Methode an fester Phase (Festphasensynthese) synthetisiert. Bei der Synthese besteht die Möglichkeit Modifizierungen wie Fluoreszenzmarkierungen einzubauen.

Siehe auch

• Polynukleotid

Einzelnachweise

<references />