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Mascot (Software)

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Mascot Server

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Basisdaten

Maintainer Lua-Fehler in Modul:Wikidata, Zeile 1686: attempt to index field 'wikibase' (a nil value)
Entwickler Matrix Science
Erscheinungsjahr 1999
Aktuelle Version 2.6.1<ref>News: Mascot 2.6.1 patch release. Abgerufen am 6. Juni 2017 (Lua-Fehler in Modul:Multilingual, Zeile 153: attempt to index field 'data' (a nil value)).</ref>
(2. Juni 2017)
Aktuelle Vorabversion Lua-Fehler in Modul:Wikidata, Zeile 1686: attempt to index field 'wikibase' (a nil value)
(Lua-Fehler in Modul:Wikidata, Zeile 1686: attempt to index field 'wikibase' (a nil value))
Betriebssystem Windows, Linux<ref>Technical support: Current Platforms. Abgerufen am 16. Januar 2017 (Lua-Fehler in Modul:Multilingual, Zeile 153: attempt to index field 'data' (a nil value)).</ref>
Programmier­sprache Lua-Fehler in Modul:Wikidata, Zeile 1686: attempt to index field 'wikibase' (a nil value)
Kategorie Proteinidentifikation
Lizenz proprietär
deutschsprachig ja
matrixscience.com

Mascot ist eine Software zur Auswertung von Daten aus der Protein-Massenspektrometrie für die Betriebssysteme Windows und Linux.

Verwendung

Sie dient zur Identifizierung von Peptiden und Proteinen in der Proteomik, indem eine Datenbanksuche durchgeführt wird.<ref name="pmid10612281">D. N. Perkins, D. J. Pappin, D. M. Creasy, J. S. Cottrell: Probability-based protein identification by searching sequence databases using mass spectrometry data. In: Electrophoresis. Band 20, Nr. 18, Dezember 1999, S. 3551–3567, doi:10.1002/(SICI)1522-2683(19991201)20:18<3551::AID-ELPS3551>3.0.CO;2-2, PMID 10612281.</ref><ref name="pmid18707158">T. Koenig, B. H. Menze, M. Kirchner u. a.: Robust prediction of the MASCOT score for an improved quality assessment in mass spectrometric proteomics. In: J. Proteome Res. Band 7, Nr. 9, September 2008, S. 3708–3717, doi:10.1021/pr700859x, PMID 18707158.</ref>

Zahlreiche Einrichtungen verwenden Mascot, entweder als lizenzierte betriebsinterne Installation oder über den öffentlichen Webserver.

Mascot basiert auf MOWSE, entwickelt von Darryl Pappin and David Perkins am Imperial Cancer Research Fund und wurde von Cancer Research Technology lizenziert.

Die Performance verschiedener Auswertungssoftware für die Proteomik kann in einer Studie der Proteome Informatics Research Group (iPRG) eingesehen werden.<ref>PDF-Download von 6,23 MB: <templatestyles src="Webarchiv/styles.css" />iPRG 2011: A Study on the Identification of Electron Transfer Dissociation (ETD) Mass Spectra (Memento vom 10. März 2012 im Internet Archive) (englisch).</ref>

Einzelnachweise

<references />