https://wiki-de.moshellshocker.dns64.de/index.php?action=history&feed=atom&title=Xyz-Format 2026-05-28T00:31:17Z Versionsgeschichte dieser Seite in Wikipedia (Deutsch) – Lokale Kopie MediaWiki 1.43.8 https://wiki-de.moshellshocker.dns64.de/index.php?title=Xyz-Format&diff=477796&oldid=prev 2025-05-12T10:46:31Z

<p><span class="autocomment">Formatspezifikation: </span> Linkfix</p> <p><b>Neue Seite</b></p><div>{{SEITENTITEL:xyz-Format}}<br /> Das &#039;&#039;&#039;xyz-Format&#039;&#039;&#039; wird in der [[Computerchemie]] und [[Bioinformatik]] verwendet und enthält [[Kartesisches Koordinatensystem|kartesische Koordinaten]] in drei [[Dimension (Größensystem)|Dimensionen]] zur Beschreibung der Positionen von [[Atom]]en in [[Molekül]]en. Als Maßeinheit werden meist [[Ångström (Einheit)|Ångström]], seltener [[atomare Einheiten]] verwendet. <br /> <br /> Dieses Format wird von vielen Programmen verstanden, eine formale Definition wurde aber nie veröffentlicht. Deshalb kann sich das Format je nach verwendetem Computerprogramm leicht unterscheiden, bzw. das jeweilige Programm kann Probleme beim Lesen nicht-konformer xyz-Dateien haben.<br /> <br /> == Formatspezifikation ==<br /> Wie die meisten in der Computerchemie verwendeten Dateiformate ist auch das xyz-Format zeilenorientiert aufgebaut:<br /> 1. Zeile: Anzahl der Atome (Ganzzahl)<br /> 2. Zeile: Kommentar (Zeichenkette)<br /> 3. Zeile und folgende: Elementname x- y- z-Koordinaten (Zeichenkette bzw. Ganzzahl, 3 Kommazahlen)<br /> <br /> In seiner allgemeinsten Spielart erlaubt das xyz-Format in den Atomspezifikationen ab der dritten Zeile noch die Angabe einer (Atomladung, Kommazahl), dreier (kartesischer Schwingungsvektor, 3 Kommazahlen) oder vierer (Schwingungsvektor und Atomladung) zusätzlicher Spalten.<br /> Element x y z [x-vektor y-vektor z-vektor] [q]<br /> <br /> Anders als andere weitverbreitete Dateiformate (z.&amp;nbsp;B. [[Protein Data Bank|pdb-Format]]) gibt das xyz-Format keine festen Zahlenformate und -positionen vor.<br /> <br /> == Beispiel ==<br /> Im Folgenden ist eine Beispieldatei für das Wassermolekül dargestellt. Alle Koordinatenangaben (ab Zeile 3, Spalte 2 bis 4) sind in Ångström, die Ladungen als Vielfaches der Elementarladung angegeben:<br /> <br /> 3<br /> Wassermolekül, in x-y-Ebene liegend; AM1-Rechnung<br /> O 0.000000 0.000000 0.000000 -0.382710<br /> H 0.961151 0.000000 0.000000 0.191355<br /> H -0.224986 0.934448 0.000000 0.191355<br /> <br /> == Weblinks ==<br /> *[http://openbabel.org/wiki/XYZ_%28format%29 The XYZ file specification | OpenBabel]<br /> *[http://www.ch.ic.ac.uk/chemime/ Infos bei Chemical MIME]<br /> <br /> [[Kategorie:Datenformat]]<br /> [[Kategorie:Computerchemie]]<br /> [[Kategorie:Theoretische Chemie]]</div>

imported>Bibonius