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<p><b>Neue Seite</b></p><div>Die '''Universal Protein Database''', kurz '''UniProt''', ist die größte [[Bioinformatik|bioinformatische]] [[Biochemie-Datenbank|Datenbank]] für [[Protein]]e aller Lebewesen und [[Viren]], und enthält Informationen über die Proteinfunktion und -[[Proteinstruktur|struktur]] sowie Links zu anderen themenrelevanten Datenbanken.<ref>The UniProt Consortium (2007):'' The Universal Protein Resource (UniProt).'' In: ''[[Nucleic Acids Res.]]'' Bd. 35, S. D193-D197. PMID 17142230, {{DOI|10.1093/nar/gkl929}}.</ref> Sie ist frei zugänglich.<br />
<br />
== Zusammensetzung ==<br />
Die Datenbank wird von einem [[Konsortium]], das 2002 gebildet wurde, betrieben. Die Datenbank kombiniert Informationen aus drei zuvor getrennten Quellen: <br />
<br />
* TrEMBL vom [[European Bioinformatics Institute]] (EBI), welches Teil des [[Europäisches Laboratorium für Molekularbiologie|EMBL]] ist, daher der Name<br />
* Swiss-Prot vom [[Swiss Institute of Bioinformatics]] (SIB)<br />
* Protein Sequence Database (PIR-PSD) vom [[Protein Information Resource]] (PIR) an der [[Georgetown University]] in den USA. <br />
<br />
Das EBI verfügt über eine große Quelle bioinformatischer Daten, das SIB beherbergt die Server des ([[ExPASy]]) ('''Ex'''pert '''P'''rotein '''A'''nalysis '''Sy'''stem), welche essentielle Informationen für die [[Proteomik]] bereitstellen. PIR leitet sich von der ältesten Proteinsequenzdatenbank ([[Margaret Oakley Dayhoff]]s ''Atlas of Protein sequence and structure'') ab.<br />
<br />
== Die UniProt-Datenbanken ==<br />
Jedes Mitglied des UniProt-Konsortiums pflegt die Datenbanken. Bis 2002<ref>{{Internetquelle |url=https://www.uniprot.org/help/about |titel=UniProt |abruf=2024-09-17}}</ref> produzierten EBI und SIB zusammen Swiss-Prot und TrEMBL. Das PIR stellte die Datenbank PIR-PSD (Protein Sequence Database) zur Verfügung.<br />
<br />
Swiss-Prot ist wohl die bekannteste Proteindatenbank auf Grund ihrer ausführlichen Querverweise, Literaturzitate, der Integration anderer Datenbanken und ihrer minimalen Redundanz. TrEMBL (Translated EMBL Nucleotide Sequence Data Library) ist eine Computer-annotierte Ergänzung der Swiss-Prot-Datenbank, die alle Übersetzungen von EMBL-Nukleotid-Einträgen enthält, die noch nicht in Swiss-Prot integriert vorliegen. Dies ermöglicht eine schnelle Datenbereitstellung.<br />
<br />
== Organisation ==<br />
UniProt beinhaltet drei Elemente, die auf einen bestimmten Gebrauch spezialisiert sind:<br />
<br />
* Die UniProt Knowledgebase (''UniProtKB'') ist die zentrale Datenbank für Proteinsequenzen. Sie gibt Informationen über die Funktion und Klassifikationen der Proteine und stellt Querverweise her.<br />
* Das UniProt Archive (''UniParc'') speichert die Gesamtheit aller öffentlich erhältlichen Proteinsequenzdaten.<br />
* Die UniProt Reference Clusters (''UniRef'') sind Datenbanken, die dem Benutzer eine schnellere Suche ermöglichen, indem sie verhindern, dass redundante Verknüpfungen verfügbarer Sequenzen erscheinen. So werden unter anderem identische Sequenzen und Vor-Fragmente (von verschiedenen Organismen) in einer Dateneintragung kombiniert.<br />
<br />
== Weblinks ==<br />
* [https://www.uniprot.org/ UniProt-Homepage]<br />
* [https://www.uniprot.org/help/ UniProt-Hilfeseite]<br />
<br />
== Einzelnachweise ==<br />
<references /><br />
<br />
[[Kategorie:Biochemie-Onlinedatenbank]]</div>imported>Skopien