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2025-03-03T15:24:42Z

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Das '''Transkriptom''' ist die Summe aller zu einem bestimmten Zeitpunkt in einer [[Zelle (Biologie)|Zelle]] [[Transkription (Biologie)|transkribierten]], das heißt von der [[Desoxyribonukleinsäure|DNA]] in [[Ribonukleinsäure|RNA]] umgeschriebenen [[Gen]]e, also die Gesamtheit aller in einer Zelle hergestellten RNA-[[Molekül]]e.

== Eigenschaften ==
Der Begriff ist vergleichbar mit dem [[Proteom]], der Gesamtheit der zu einem bestimmten Zeitpunkt in einer Zelle vorliegenden [[Proteine]]. Da aber nicht jede nach der Transkription vorliegende RNA, wie z. B. [[Ribosomale RNA|rRNA]] oder die RNA von [[Ribonukleoprotein]]en, in ein Protein übersetzt ([[Translation (Biologie)|translatiert]]) wird und [[mRNA]]s noch [[RNA-Prozessierung|prozessiert]] werden können, sind Proteom und Transkriptom einer Zelle nicht identisch.

Zur Analyse des Transkriptoms wird in aller Regel auf Methoden wie eine [[RT-PCR]] mit degenerierten [[Primer]]n zurückgegriffen, gefolgt von einem [[DNA-Chip-Technologie|DNA-Microarray]] oder einer [[DNA-Sequenzierung]] im Hochdurchsatz ([[RNA-Seq]]). RNA-Protein-Interaktionen können mit Methoden wie [[RIP-Chip]], [[CLIP-Seq]], [[PAR-CLIP]] oder [[ICLIP]] untersucht werden.<ref>{{cite journal |author=Khalil AM, Guttman M, Huarte M, ''et al.'' |title=Many human large intergenic noncoding RNAs associate with chromatin-modifying complexes and affect gene expression |journal=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. |year=2009 |month=July |pmid=19571010 |pmc=2704857 |doi=10.1073/pnas.0904715106 |volume=106 |issue=28 |pages=11667–72}}</ref><ref>{{cite journal | author = Darnell RB | year = 2010 | title = HITS-CLIP: panoramic views of protein-RNA regulation in living cells | url = | journal = Wiley Interdiscip Rev RNA. | volume = 1 | issue = | pages = 266–86 | doi = 10.1002/wrna.31 }}</ref><ref name="pmid20371350">{{cite journal |author=Hafner M, Landthaler M, Burger L, Khorshid M, Hausser J, Berninger P, Rothballer A, Ascano M Jr, Jungkamp AC, Munschauer M, Ulrich A, Wardle GS, Dewell S, Zavolan M, Tuschl T. |title=Transcriptome-wide identification of RNA-binding protein and microRNA target sites by PAR-CLIP. |journal=Cell |volume=141 |issue=1 |pages=129–141 |year=2010 |pmid=20371350 |doi=10.1016/j.cell.2010.03.009 |pmc=2861495}}</ref><ref>J. König, K. Zarnack, G. Rot, T. Curk, M. Kayikci, B. Zupan, D. J. Turner, N. M. Luscombe, J. Ule: ''iCLIP reveals the function of hnRNP particles in splicing at individual nucleotide resolution.'' In: ''Nature Structural Molecular Biology'' (2010), Band 17, Ausgabe 7, S. 909–915. {{DOI|10.1038/nsmb.1838}}. PMID 20601959; {{PMC|3000544}}.</ref> Eine andere Methode, bei der auch die Aktivität unbekannter Gene beobachtet werden kann, ist die so genannte [[Serielle Analyse der Genexpression]] (SAGE) und [[SuperSAGE]].

Unter dem Begriff der ''Transkriptomik'' versteht man die Studie der [[mRNA]]-Expression einer Zelle. Der Begriff ist eine Analogie zum Begriff [[Proteomik]]<ref name="Voet">Donald Voet, Judith G. Voet, Charlotte W. Pratt: ''Lehrbuch der Biochemie.'' Weinheim 2019, ISBN 978-3-527-34286-0, S. 67</ref> und synonym zur [[Genexpressionsanalyse]].

== Literatur ==
* [[Volker Erdmann]], Jan Barciszewski: ''RNA Technologies'', Springer Berlin, 2012, ISBN 978-3642264900.

== Einzelnachweise ==
<references />

[[Kategorie:Genetik]]
[[Kategorie:Biochemie]]

Transkriptom - Versionsgeschichte

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