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Unter '''short interspersed nuclear elements''' ('''SINE''', engl. für ‚kurze, eingestreute Kernsequenzelemente‘) versteht man typischerweise 100–400 [[Basenpaar]]e lange, häufig wiederholte und relativ frei verteilte [[DNA-Sequenz]]en im [[Genom]]. SINEs werden häufig zu den [[Transposon|transponierbaren Elementen]] gerechnet, die eine [[Ribonukleinsäure|RNA]] als Zwischenstufe benutzen ([[Retroelement]]) und keine ''long terminal repeats'' (Non-LTR [[Retrotransposon]]s) besitzen. Transponierbare Elemente im engeren Sinn sind jedoch definiert als DNA-Sequenzen, die selbst eine Transposase kodieren und damit eine intrinsische Fähigkeit besitzen, ihre genomische Position zu ändern. Im Gegensatz zu den längeren [[Long interspersed nuclear element|LINEs]] sind SINEs somit nicht autonom, sondern benötigen eine externe [[Reverse Transkriptase]] (oft von LINEs codiert), da sie keine eigene (mehr) besitzen.

SINEs stimmen in der [[3'-Sequenz]] oftmals mit LINE-Sequenzen überein und sind oft entartete [[Gen]]e für [[kleine RNA]]s, wie die [[7SL-RNA]], oder [[tRNA]]s. tRNA-verwandte SINEs besitzen eine zusammengesetzte Struktur mit einer Region, die homolog zu einer tRNA ist, einer nicht tRNA-ähnlichen Region sowie einem variablen (8–50 [[Basenpaar|bp]]) AT-reichen 3'-Ende. Die tRNA-homologe Sequenz enthält einen [[RNA-Polymerase|RNA-Polymerase-III]]-[[Promotor (Genetik)|Promotor]]. Sie werden demnach durch die RNA-Polymerase III [[Transkription (Biologie)|transkribiert]].

Eine bedeutende SINE-Familie ist die sogenannte [[Alu-Sequenz|''Alu''-Familie]], die nur in [[Primaten]] vorkommt. Andere Familien kommen bei sämtlichen [[Säugetier]]en (auch [[Kloakentiere]] und [[Beuteltiere]]) vor und werden daher auch als ''mammalian-wide interspersed repeats'' (MIR) bezeichnet. Bei einigen Organismen, wie z. B. der Fruchtfliege ''[[Drosophila melanogaster]]'' oder dem [[Nematode]]n ''[[Caenorhabditis elegans]]'' fehlen SINEs.<ref>T. H. Eickbush, A. V. Furano: ''Fruit flies and humans respond differently to retrotransposons.'' In: ''Current opinion in genetics & development.'' Band 12, Nummer 6, Dezember 2002, S. 669–674, {{ISSN|0959-437X}}. PMID 12433580. (Review).</ref>

SINEs machen im [[mensch]]lichen Genom ca. 14 % aus.

Auch in vielen pflanzlichen Genomen kommen SINEs vor.<ref>{{Literatur |Autor=Torsten Wenke, Thomas Döbel, Thomas Rosleff Sörensen, Holger Junghans, Bernd Weisshaar |Titel=Targeted Identification of Short Interspersed Nuclear Element Families Shows Their Widespread Existence and Extreme Heterogeneity in Plant Genomes[W] |Sammelwerk=The Plant Cell |Band=23 |Nummer=9 |Datum=2011-09 |ISSN=1040-4651 |Seiten=3117–3128 |DOI=10.1105/tpc.111.088682 |PMC=3203444 |PMID=21908723}}</ref> Zum Beispiel sind SINEs in verschiedenen Getreidearten in hoher Vielfalt und mit variierenden Kopienanzahlen verbreitet.<ref>{{Literatur |Autor=Anja Kögler, Thomas Schmidt, Torsten Wenke |Titel=Evolutionary modes of emergence of short interspersed nuclear element (SINE) families in grasses |Sammelwerk=The Plant Journal |Band=92 |Nummer=4 |Datum=2017-11-01 |ISSN=1365-313X |Seiten=676–695 |DOI=10.1111/tpj.13676}}</ref>

== Literatur ==
* P. Capy, C. Bazin, u. a.: ''Dynamics and Evolution of Transposable Elements.'' Landes Bioscience and Chapman & Hall, 1998.

== Einzelnachweise ==
<references />

[[Kategorie:Nukleinsäure]]
[[Kategorie:Mobiles genetisches Element]]

[[en:Retrotransposon#SINEs]]

Short Interspersed Nuclear Element - Versionsgeschichte

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