https://wiki-de.moshellshocker.dns64.de/index.php?action=history&feed=atom&title=SequenzmotivSequenzmotiv - Versionsgeschichte2026-06-08T19:05:56ZVersionsgeschichte dieser Seite in Wikipedia (Deutsch) – Lokale KopieMediaWiki 1.43.8https://wiki-de.moshellshocker.dns64.de/index.php?title=Sequenzmotiv&diff=618916&oldid=previmported>Aka: Punkt ergänzt, ISBN-Format, Kleinkram2024-10-19T12:26:56Z<p>Punkt ergänzt, ISBN-Format, Kleinkram</p>
<p><b>Neue Seite</b></p><div>Als '''Sequenzmotiv''', umgangssprachlich kurz '''Motiv''', wird in der [[Biochemie]] ein bestimmter Abschnitt auf einer [[Nukleinsäure]] ([[Desoxyribonukleinsäure|DNA]] oder [[Ribonukleinsäure|RNA]]) oder einem [[Protein]] bezeichnet, der an verschiedenen Stellen (DNA) bzw. auf verschiedenen Molekülen (RNA und Protein) wiederkehrt und dem eine biologische Bedeutung beigemessen wird. Häufig besteht eine gewisse Variabilität in der Sequenz; in solchen Fällen ist es sinnvoll, eine [[Konsensussequenz]] zu bestimmen. Diese definiert die Sequenz weniger stringent, weil sie an bestimmten Stellen Alternativen zulässt.<br />
<br />
== Beispiele ==<br />
=== DNA-Motiv ===<br />
Ein Beispiel für ein DNA-Motiv ist das κB-Motiv, dessen Konsensussequenz folgende Struktur aufweist:<br />
<br />
: <span style="font-family:monospace;">5'-GGGRNNYYCC-3'</span><br />
<br />
Die DNA ist hier vom 5'- zum 3'-Ende dargestellt (siehe [[Nukleinsäure-Nomenklatur]]), wobei ''R'' für ein Purinnukleotid, ''Y'' für Pyrimidinnukleotid und ''N'' für ein beliebiges Nukleotid steht.<br />
<br />
Das κB-Motiv befindet sich in den regulatorischen Abschnitten zahlreicher [[Gen]]e und wird vom [[Transkriptionsfaktor]] [[NF-κB]] erkannt. Eine Bindung verstärkt in den meisten Fällen die [[Transkription (Biologie)|Transkription]] abhängiger Gene.<br />
<br />
=== Protein-Motiv ===<br />
Es bestehen zahlreiche verschiedene Proteinmotive. Eine wichtige Funktion kommt ihnen vor allem bei [[Phosphorylierung]]en im Rahmen der [[Signaltransduktion]] zu. Zur Darstellung des Motivs wird der für [[Aminosäure]]n allgemein gebräuchliche Einbuchstaben- oder der Dreibuchstabencode verwendet. So steht bei dem [[IQ-Motiv]]<br />
<br />
:IQxxxRxxxxR<br />
<br />
''I'' für [[Isoleucin]], ''Q'' für [[Glutamin]] und ''R'' für [[Arginin]].<br />
<br />
Dieses Sequenzmotiv faltet im nativen Protein zu einer helikalen Sekundärstruktur auf, die als Strukturmotiv eine Bindedomäne für leichte Ketten darstellt.<br />
<br />
== Literatur ==<br />
* Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, [[Lubert Stryer]]: ''Biochemie.'' 6. Auflage, Spektrum Akademischer Verlag, Heidelberg 2007. ISBN 978-3-8274-1800-5.<br />
* Donald Voet, Judith G. Voet: ''Biochemistry.'' 3. Auflage, John Wiley & Sons, New York 2004. ISBN 0-471-19350-X.<br />
* [[Bruce Alberts]], Alexander Johnson, Peter Walter, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts: ''Molecular Biology of the Cell'', 5. Auflage, Taylor & Francis 2007, ISBN 978-0-8153-4106-2.<br />
<br />
[[Kategorie:Biochemie]]<br />
[[Kategorie:Genetik]]<br />
[[Kategorie:Bioinformatik]]</div>imported>Aka