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'''PubChem''' ist eine freie [[Datenbank]] [[Chemische Verbindung|chemischer Verbindungen]].<ref>{{Literatur |Titel=DATABASE: Small-Molecule Central |Sammelwerk=Science |Band=306 |Nummer=5697 |Datum=2004-10-29 |Seiten=787–787 |DOI=10.1126/science.306.5697.787a}}</ref><ref>{{Literatur |Autor=Sunghwan Kim |Titel=Exploring Chemical Information in PubChem |Sammelwerk=Current Protocols |Band=1 |Nummer=8 |Datum=2021-08 |DOI=10.1002/cpz1.217 |PMC=8363119 |PMID=34370395}}</ref> PubChem wird unterhalten vom nationalen Zentrum für Biotechnologische Information der USA ([[National Center for Biotechnology Information]], NCBI), einem Bestandteil der nationalen medizinischen Bibliothek der USA ([[National Library of Medicine|United States National Library of Medicine]], NLM), die Teil des nationalen Instituts für Gesundheit der USA ([[National Institutes of Health]], NIH) ist.

PubChem ist mit den anderen Datenbanken des [[Entrez]]-Portals wie z. B. [[PubMed]] verlinkt. Neben den üblichen Merkmalen zur Textsuche bietet PubChem eine Struktur- und Substruktursuche auf Basis von gezeichneten Strukturformeln an. Alternativ kann eine Struktur auch über eine Datei eingelesen werden.

== Geschichte ==
Im Jahr 2004 war die erste Veröffentlichung der Datenbank, d. h. der Beginn von PubChem.<ref>{{Internetquelle |url=https://pubchemdocs.ncbi.nlm.nih.gov/news |titel=News |datum=September 16, 2004 |sprache=en |abruf=2021-11-16}}</ref>

== Datensätze ==
Es sind 824 Datenquellen (Stand 2021) an PubChem angeschlossen.<ref>{{Internetquelle |url=https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/sources |titel=Data Sources - PubChem |abruf=2021-11-15}}</ref>

Die folgenden Datensätze werden durch PubChem abgebildet (Stand 2021):<ref>{{Internetquelle |url=https://pubchemdocs.ncbi.nlm.nih.gov/statistics |titel=PubChem Statistics |abruf=2021-11-15}}</ref><ref>{{Internetquelle |url=https://pubchemdocs.ncbi.nlm.nih.gov/data-organization |titel=Data Organization |abruf=2021-11-15}}</ref>
{| class="wikitable"
!Kollektion<ref>{{Internetquelle |url=https://pubchemdocs.ncbi.nlm.nih.gov/what-s-in-pubchem |titel=What's in PubChem? |abruf=2021-11-16}}</ref>
!Einträge
!Original-Beschreibung (englisch)
!zu Deutsch ([[Google Translate]])
|-
|Compounds
|110.953.228
|Unique chemical structures extracted from contributed PubChem Substance records
|Einzigartige chemische Strukturen, die aus beigesteuerten PubChem-Substance-Datensätzen extrahiert wurden
|-
|Substances
|276.898.579
|Information about chemical entities provided by PubChem contributors
|Von PubChem-Mitwirkenden bereitgestellte Informationen zu chemischen Stoffen
|-
|BioAssays
|1.391.562
|Biological experiments provided by PubChem contributors
|Biologische Experimente von PubChem-Mitwirkenden
|-
|Bioactivities
|292.633.795
|Biological activity data points reported in PubChem BioAssays
|In PubChem BioAssays gemeldete Datenpunkte zur biologischen Aktivität
|-
|Genes
|103.715
|Gene targets tested in PubChem BioAssays and those involved in PubChem Pathways
|In PubChem BioAssays ([[Bioassay|Bioaktivitätstests]]) getestete Gen-Targets und solche, die an PubChem Pathways beteiligt sind
|-
|Proteins
|96.561
|Protein targets tested in PubChem BioAssays and those involved in PubChem Pathways
|In PubChem BioAssays getestete Protein-Targets und solche, die an PubChem Pathways beteiligt sind
|-
|Taxonomy
|531.241
|Organisms of targets tested in PubChem BioAssays and those involved in PubChem Pathways
|In PubChem BioAssays getestete Zielorganismen und solche, die an PubChem Pathways beteiligt sind
|-
|Pathways
|238.597
|Interactions between chemicals, genes, and proteins
|Wechselwirkungen zwischen Chemikalien, Genen und Proteinen
|-
|Literature
|33.276.936
|Scientific publications with links in PubChem
|Wissenschaftliche Publikationen mit Links in PubChem
|-
|Patents
|28.543.965
|Patents with links in PubChem
|Patente mit Links in PubChem
|}

== Zitation ==
Die gewünschte Zitation der Datenbank ist wie folgt:<ref>{{Internetquelle |url=https://pubchemdocs.ncbi.nlm.nih.gov/publications |titel=Publications |abruf=2021-11-15}}</ref>
<syntaxhighlight lang="bibtex">
Kim S, Chen J, Cheng T, Gindulyte A, He J, He S, Li Q, Shoemaker BA, Thiessen PA, Yu B, Zaslavsky L, Zhang J, Bolton EE. PubChem in 2021: new data content and improved web interfaces. Nucleic Acids Res. 2021 Jan 8; 49(D1):D1388–D1395. doi:10.1093/nar/gkaa971.
[PubMed PMID 33151290] [PubMed Central PMCID: PMC7778930] [Free Full Text]
</syntaxhighlight>
Eine Detailbeschreibung und weitere Beispiele können dem Handbuch entnommen werden.<ref>{{Internetquelle |url=https://pubchemdocs.ncbi.nlm.nih.gov/citation-guidelines |titel=Citation Guidelines |abruf=2021-11-16}}</ref>

== Literatur ==
* S. Kim, P. A. Thiessen, T. Cheng u. a.: ''Literature information in PubChem: associations between PubChem records and scientific articles.'' In: ''J Cheminform.'' Band 8, 2016, S. 32. [[doi:10.1186/s13321-016-0142-6]]
* ''PubChem.'' In: ''Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics and Informatics.'' Springer, Dordrecht 2008. [[doi:10.1007/978-1-4020-6754-9_13806]]
* P. M. Selzer, R. J. Marhöfer, O. Koch: ''Biologische Datenbanken.'' In: ''Angewandte Bioinformatik.'' Springer Spektrum, Berlin/Heidelberg 2018. [[doi:10.1007/978-3-662-54135-7_2]]

== Siehe auch ==
* [[ChemIDplus]]
* [[ChemSpider]]

== Weblinks ==
* [http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ PubChem Webseite]
* [https://pubchemblog.ncbi.nlm.nih.gov/ PubChem Blog] (seit 2013)
* [http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/help.html Hilfeseite bei PubChem] (Handbuch)
* [https://pubchemdocs.ncbi.nlm.nih.gov/downloads Informationen zum Download]
* [https://www.youtube.com/watch?v=-eNxsNd8sC4 NCBI Minute: PubChem, a Source of Laboratory Chemical Safety Information] (YouTube; 21 Min.)

== Einzelnachweise ==
<references />

[[Kategorie:Chemie-Onlinedatenbank]]
[[Kategorie:Biologie-Onlinedatenbank]]
[[Kategorie:Medizininformatik]]
[[Kategorie:National Institutes of Health]]
[[Kategorie:Online-Datenbank (Gesundheit)]]
[[Kategorie:Online seit 2004]]

PubChem - Versionsgeschichte

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