https://wiki-de.moshellshocker.dns64.de/index.php?action=history&feed=atom&title=PfamPfam - Versionsgeschichte2026-06-06T15:17:16ZVersionsgeschichte dieser Seite in Wikipedia (Deutsch) – Lokale KopieMediaWiki 1.43.8https://wiki-de.moshellshocker.dns64.de/index.php?title=Pfam&diff=704450&oldid=previmported>APPERbot: Bot: zu viel Abstand am Absatzende entfernt2024-08-04T02:57:19Z<p>Bot: zu viel Abstand am Absatzende entfernt</p>
<p><b>Neue Seite</b></p><div>'''Pfam''' ('''P'''rotein '''Fam'''ilies) ist eine frei zugängliche [[Biochemie-Datenbank|Datenbank]] für [[Bioinformatik|bioinformatische]] Zwecke. Es handelt sich zum einen um eine maschinelle Kategorisierung von [[Proteindomäne]]n, die alle bekannten [[Proteine]] einschließt. Grundlage ist die [[Mustererkennung]] mittels [[Machine Learning]] der [[Aminosäuresequenz]]. Die so ermittelten [[Muster]] können zum anderen in neuen Proteinen wiedergefunden werden, was einen Hinweis auf die Zusammensetzung dieser Proteine aus Domänen, und damit auch auf ihre Funktion, bzw. bei [[Enzym]]en auf die [[enzymatische Aktivität]] gibt. Für diese Vorhersage stellt Pfam einen Webservice bereit.<br />
<br />
Pfam besteht aus zwei Teilen, Pfam-A und Pfam-B. In Pfam-A sind gut charakterisierte Domänen zusammengefasst, während sich Domänen mit unbekannter Funktion in Pfam-B befinden. Bei der Methode des maschinellen Clustering und der Mustererkennung handelt es sich um [[Hidden Markov Model]]le.<ref>R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison: ''Biological Seqeuence Analysis''. Cambridge University Press, Cambridge 1998, ISBN 0-521-62041-4.</ref><br />
<br />
Pfam wurde 1997 von den Bioinformatikern Erik Sonnhammer ([[Karolinska Institutet]] bei Stockholm), Sean Eddy ([[Washington University in St. Louis]], USA), und Richard Durbin ([[Wellcome Trust Sanger Institute]] bei Cambridge, UK) aufgebaut.<ref>E. L. Sonnhammer, S. R. Eddy, R. Durbin: ''Pfam: a comprehensive database of protein domain families based on seed alignments.'' In: ''Proteins.'' 28, 1997, S. 405–420. PMID 9223186</ref> Um etliche Funktionalitäten erweitert, kam Anfang 2006 die [[Update (Datenbank)|Aktualisierung]] 18 heraus.<ref>R. D. Finn, J. Mistry, B. Schuster-Bockler, S. Griffiths-Jones, V. Hollich, T. Lassmann, S. Moxon, M. Marshall, A. Khanna, R. Durbin, S. R. Eddy, E. L. Sonnhammer, A. Bateman: ''Pfam: clans, web tools and services.'' In: ''[[Nucleic Acids Res.]]'' 34, 2006, S. D247–D251. PMID 16381856</ref> Im März 2013 wurde Pfam 27.0 veröffentlicht.<ref>pfam.sanger.ac.uk: {{Webarchiv |url=http://pfam.sanger.ac.uk/help#tabview=tab3 |text=Pfam 27.0 (Mar 2013, 14831 families) |wayback=20100217215251 |archiv-bot=}}</ref><br />
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== Weblink ==<br />
* [http://pfam.xfam.org/ Homepage von Pfam]<br />
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== Literatur ==<br />
<references /><br />
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[[Kategorie:Bioinformatik]]<br />
[[Kategorie:Biochemie-Onlinedatenbank]]<br />
[[Kategorie:Abkürzung]]</div>imported>APPERbot