imported>Sicherlich: siehe erläuterung zur Vorlage: Vorlage:Lückenhaft: "grob verzerrend" ist hier nichts. Es wäre erweiterungswürdig. Wie wohl so ziemlich alles in der Wikipedia

2026-01-08T21:42:14Z

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{{Begriffsklärungshinweis|Zum künstlichen Raumflugkörper siehe [[Kleinsatellit]].}}
'''Mikrosatelliten''' (synonym {{lang|en|''Simple Sequence Repeats'', ''SSR'', ''short tandem repeats'', ''STR''}}) sind kurze, meist [[Nichtcodierende Desoxyribonukleinsäure|nichtcodierende DNA]]-Sequenzen von zwei bis sechs [[Basenpaar]]en Länge, die im [[Genom]] eines [[Organismus]] oft wiederholt werden.<ref name="Butler">John M. Butler: ''Forensic DNA Typing.'' Academic Press, 2005, ISBN 978-0-08-047061-0, S. 85.</ref> Oftmals konzentrieren sich viele Wiederholungen am selben [[Genlocus|Locus]] (Position einer Sequenz). Sie kommen gehäuft in [[Eukaryoten]] vor.<ref name="Butler2">John M. Butler: ''Fundamentals of Forensic DNA Typing.'' Academic Press, 2009, ISBN 978-0-08-096176-7, S. 148.</ref> Die STR gehören neben den VNTR ({{lang|en|''variable number of tandem repeats,''|de=variable Anzahl an Tandemwiederholungen}}) zur Gruppe der ''SSLP'' ({{lang|en|''Simple sequence length polymorphism''|de=einfacher Sequenzlängenpolymorphismus}}).

== Eigenschaften ==
[[Datei:DNA palindrome.svg|mini|[[Palindromische Sequenz|Palindromische]] Mikrosatelliten können [[Haarnadelstruktur]]en ausbilden]]
Die wiederholte Sequenz in einem Mikrosatelliten ist sehr einfach. Sie besteht aus zwei bis vier [[Nukleotid]]en und kann 10- bis 100-mal wiederholt auftreten. Mikrosatelliten kommen, je nach Zählung, über eine Million Mal im menschlichen [[Genom]] vor.<ref name="Butler2" /> Sequenziert man am Locus eines Mikrosatelliten, so erhält man Sequenzen wie „TAGTAGTAGTAGTAGTAG…“. Mikrosatelliten sind die häufigste Form repetitiver DNA. Am häufigsten sind die [[Dinukleotid]]wiederholungen vom Typ (CA)n. Diese machen etwa 0,5 % des Genoms aus.

Mikrosatelliten können zur Genanalyse ([[STR-Analyse]]) verwendet werden, da die Anzahl der Wiederholungen sich auch bei verschiedenen Individuen einer [[Art (Biologie)|Art]] unterscheidet. Auf diese Weise können [[Polymorphismus|Polymorphismen]] in der DNA festgestellt werden.

Eine Analyse der Länge der beiden Mikrosatelliten an einem bestimmten Ort ([[Genlocus|Locus]]) im Genom erfolgt durch die [[Polymerase-Kettenreaktion|PCR]]-Analyse. Dabei werden kurze synthetische Oligonukleotide (sogenannte [[Primer]]) verwendet, die komplementär zu denjenigen DNA-Sequenzen sind, die den interessierenden Mikrosatellit flankieren. Die beiden (meist unterschiedlichen) Produkte der PCR können durch [[Gelelektrophorese]] aufgetrennt und deren Länge damit bestimmt werden. Als Ergebnis werden oftmals zwei Zahlen angegeben, die der Anzahl der Wiederholungen des Motivs entspricht (z. B. ''TH01 6,9'' bedeutet, der STR-Marker TH01 hat 6 Wiederholungen auf dem ersten und 9 Wiederholungen auf dem zweiten Allel der untersuchten Person).

== Programme zur Suche von Mikrosatelliten ==
{| style="font-size: 85%; text-align: center;" class="wikitable"
|-
! Programm
! Algorithmus
! perfekte
! imperfekte
! Motivgrößen, perfekt
! Motivgrößen, imperfekt
! braucht Motivbibliothek
! erkennt alternative Alignierungen
! findet teilweise oder ganz überlappende Mikrosatelliten
! Besonderheiten
|-
| [http://misaweb.ipk-gatersleben.de/ MISA]
|exakt
|ja
|nein
|1 bis Länge der Sequenz
| -
|nein
|?
|ja
|
|-
| [http://www.rub.de/spezzoo/cm/cm_phobos.htm Phobos]
| exakt
| ja
| ja
| 1 - >5000
| 1 - >50
| nein
| ja
| ja
|
|-
| [http://bibiserv.techfak.uni-bielefeld.de/reputer REPuter]
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|-
| [http://kofler.or.at/bioinformatics/SciRoKo/index.html SciRoKo]
| exakt
| ja
| ja
| 1-6
| 1-6
| nein
| ?
| ?
| interaktive Analyse der Resultate
|-
| Sputnik
| exakt
| ja
| ja
| 1-5
| 1-5
| nein
| nein
| nein
|
|-
| [http://tandem.bu.edu/trf/trf.html Tandem Repeats Finder]
| probabilistisch
| ja
| ja
| 1-2000
| 1-2000
| nein
| ja
| ja
|
|-
| [http://finder.sourceforge.net Troll]
| exakt
| ja
| nein
| 1-6
| -
| ja
| nein
| ?
|
|}

== Siehe auch ==
*[[Satelliten-DNA]]
*[[Minisatellit]]
*[[Mikrosatelliteninstabilität]]

== Einzelnachweise ==
<references />

[[Kategorie:Repetitive DNA]]

Mikrosatellit - Versionsgeschichte

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