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2021-10-06T21:25:54Z

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Als '''Konsensussequenz''' wird diejenige [[Nukleotidsequenz|Sequenz]] von [[Nukleotid]]en oder [[Aminosäure]]n bezeichnet, welche in der Summe am wenigsten von einer gegebenen Menge von entsprechenden Mustersequenzen abweicht. Die genaue Beschaffenheit dieser Sequenz kann hierbei je nach Wahl des [[Abstandsmaß]]es, wie etwa [[Hamming-Abstand|Hamming-]] oder [[Levenshtein-Distanz]], variieren.

Meist liegt der Erstellung einer Konsensussequenz die Annahme zugrunde, dass die gegebenen Sequenzen einen gemeinsamen [[evolution]]ären Ursprung haben oder ein [[Sequenzmotiv]] mit einer bestimmten biologischen Aufgabe repräsentieren, wobei es oft auch sinnvoll sein kann, mehrdeutige Konsensussequenzen zu formulieren.

Bei Nukleinsäuren können hierfür die Basensymbole der [[Nukleinsäure-Nomenklatur]] verwendet werden, also neben den eindeutigen Basensymbolen A,C,G,T,U auch beispielsweise R für eine beliebige [[Purinbase]], Y für eine beliebige [[Pyrimidinbase]] oder N für ein beliebiges Nukleotid schlechthin.

In der Regel werden Konsensussequenzen [[Heuristik|heuristisch]] aus einem [[Sequenzalignment|multiplen Sequenzalignment]] (MSA) erstellt. Im einfachsten Fall wird dasjenige Element in die Konsensussequenz aufgenommen, welches in der entsprechenden Spalte des MSA am häufigsten vorkommt.

== Literatur ==
* {{Literatur | Autor = Rainer Merkl, Stephan Waack | Titel = Bioinformatik Interaktiv: Algorithmen und Praxis | Jahr = 2003 | Verlag = [[Wiley-VCH Verlag]] GmbH | Ort = Weinheim | ISBN = 978-3-527-30662-6 | Seiten = 322f}}

[[Kategorie:Genetik]]
[[Kategorie:Bioinformatik]]
[[Kategorie:Nukleinsäure]]
[[Kategorie:Protein-Biochemie]]

Konsensussequenz - Versionsgeschichte

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