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2025-06-21T12:04:03Z

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{{Infobox Software
| Name = Jmol
| Hersteller = Jmol Development Team
| AktuelleVersion = 
| AktuelleVersionFreigabeDatum = 
| Kategorie = [[Molekulardesign]]
| Betriebssystem = [[Plattformübergreifend]]
| Deutsch = ja
| Lizenz = 
| Website = 
}}
'''Jmol''' ist ein [[Computerprogramm]] zur räumlichen Darstellung von [[Molekül]]en. Es steht unter der [[GNU Lesser General Public License]]. Da es in [[Java (Programmiersprache)|Java]] programmiert wurde, ist es weitgehend plattformunabhängig.<ref name="rescue">{{Literatur |Autor=Angel Herraez |Titel=Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue |Sammelwerk=Biochemistry and Molecular Biology Education |Band=34 |Nummer=4 |Datum=2006 |ISSN=1470-8175 |Seiten=255–261 |DOI=10.1002/bmb.2006.494034042644}}</ref> Ein [[Java-Applet]] von Jmol findet bei der Darstellung von Molekülen im [[Webbrowser]] Verwendung.<ref>{{Literatur |Autor=Egon Willighagen, Miguel Howard |Titel=Fast and Scriptable Molecular Graphics in Web Browsers without Java3D |Sammelwerk=Nature Precedings |Datum=2007 |ISSN=1756-0357 |Seiten=1–1 |DOI=10.1038/npre.2007.50.1}}</ref> beispielsweise innerhalb der [[Protein Data Bank]].<ref>{{Literatur |Autor=Peter W. Rose, Bojan Beran, Chunxiao Bi, Wolfgang F. Bluhm, Dimitris Dimitropoulos, David S. Goodsell, Andreas Prlić, Martha Quesada, Gregory B. Quinn, John D. Westbrook, Jasmine Young, Benjamin Yukich, Christine Zardecki, Helen M. Berman, Philip E. Bourne |Titel=The RCSB Protein Data Bank: redesigned web site and web services |Sammelwerk=Nucleic Acids Research |Band=39 |Nummer=suppl_1 |Datum=2011 |ISSN=0305-1048 |Seiten=D392–D401 |DOI=10.1093/nar/gkq1021}}</ref> Es implementiert und erweitert die Standards [[Simplified Molecular Input Line Entry Specification|SMILES]] und [[SMARTS]].<ref>{{Literatur |Autor=Vincent F. Scalfani, Antony J. Williams, Valery Tkachenko, Karen Karapetyan, Alexey Pshenichnov, Robert M. Hanson, Jahred M. Liddie, Jason E. Bara |Titel=Programmatic conversion of crystal structures into 3D printable files using Jmol |Sammelwerk=Journal of Cheminformatics |Band=8 |Nummer=1 |Datum=2016 |ISSN=1758-2946 |Seiten=66 |DOI=10.1186/s13321-016-0181-z |PMID=27933103}}</ref> Die Software bietet verschiedene Darstellungsmöglichkeiten, wie [[Stabmodell|Stab-]], [[Kugel-Stab-Modell|Kugel-Stab-]] und [[Kalottenmodell]], [[Punktwolke]] und [[Van-der-Waals-Radius|Van-der-Waals-Oberfläche]].<ref name="rescue" /> Auch [[Kristallstruktur]]en lassen sich darstellen.<ref>{{Literatur |Autor=R. M. Hanson |Titel=Jmol – a paradigm shift in crystallographic visualization |Sammelwerk=Journal of Applied Crystallography |Band=43 |Nummer=5 |Datum=2010 |ISSN=0021-8898 |Seiten=1250–1260 |DOI=10.1107/S0021889810030256}}</ref>
Vieles kann in Jmol mit der [[Maus (Computer)|Maus]] gesteuert werden, beispielsweise lassen sich die Moleküle um alle Raumachsen drehen und in der Größe verändern. Außerdem kann man Atomabstände und Winkel vermessen. Darüber hinaus verfügt Jmol über eine eigene [[Scriptsprache]], die Syntaxelemente von [[RasMol]] und [[MDL Chime]] geerbt hat.<ref>{{Literatur |Autor=Angel Herráez |Titel=How to Use Jmol to Study and Present Molecular Structures |Verlag=Lulu.com |Ort= |Datum=2008 |ISBN=978-1-84799-259-8 |Seiten=9}}</ref>

== Weblinks ==
{{Commonscat|Jmol}}
* [http://wiki.jmol.org/ wiki.jmol.org]

== Einzelnachweise ==
<references />

[[Kategorie:Freie Chemiesoftware]]
[[Kategorie:Java-Programm]]

Jmol - Versionsgeschichte

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