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{{Infobox DC-Projekt
| Name = Human Proteome Folding Project
| Logo =
| Ziel = Strukturvorhersage menschlicher Proteine
| Website = [http://www.worldcommunitygrid.org/research/hpf2/overview.do worldcommunitygrid.org/research/hpf2]
| Land = [[USA]]
| Status = abgeschlossen<ref>[https://secure.worldcommunitygrid.org/about_us/viewNewsArticle.do?articleId=308 End of the Human Proteome Folding - Phase 2 Project] Mitteilung zum Ende des Projekts auf der Projektseite von [[World Community Grid|WCG]]</ref>
| Plattform = [[Berkeley Open Infrastructure for Network Computing|BOINC]]
| Bereich = [[Biochemie]]
| Kommerziell =
| Beginn = 16. November 2004
| Ende = 25. Juni 2013
}}

Das '''Human Proteome Folding Project''' war ein Projekt des [[World Community Grid]] für [[verteiltes Rechnen]]. Betrieben wurde das Projekt von der [[New York University]], dem [[Institut für Systembiologie]] in [[Seattle]] und der [[University of Washington]]. Ziel dieses Projekts war die ''de novo''-Strukturvorhersage menschlicher [[Proteine]]. Als Algorithmus findet die Software des [[Rosetta@home]]-Projekts Anwendung, die aufgrund sehr guter Ergebnisse bei dem [[CASP]]-Wettbewerb als sehr leistungsfähig gilt. Das Projekt wurde in zwei Phasen durchgeführt, bei denen medizinisch besonders wichtige Proteine genauer untersucht werden.

Am 10. Juli 2007 wurde bekannt, dass der erste [[Malaria]]-relevante Datensatz an Proteinen erfolgreich berechnet wurde.

Das Projekt basiert auf der [[Berkeley Open Infrastructure for Network Computing|BOINC]]-Infrastruktur. Früher wurde ein eigener Client eingesetzt, der allerdings eingestellt wurde. Die Infrastruktur des Projekts wurde von [[IBM]] gesponsert, es handelt sich allerdings nicht um ein kommerzielles Projekt, da alle Ergebnisse auch öffentlich zugänglich sind.

== Publikationen ==
* L Malmstrom, M Riffle, CE Strauss, D Chivian, TN Davis, R Bonneau, D. Baker: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Superfamily+Assignments+for+the+Yeast+Proteome+through+Integration+of+Structure+Prediction+with+the+Gene+Ontology ''Superfamily Assignments for the Yeast Proteome through Integration of Structure Prediction with the Gene Ontology.''] In: ''[[PLoS Biol]].'', 2007 Mar 20, 5(4), S. e76.
* R Bonneau, MT Facciotti, DJ Reiss, AK Schmid, M Pan, A Kaur, V Thorsson, P Shannon, MH Johnson, JC Bare, W Longabaugh, M Vuthoori, K Whitehead, A Madar, L Suzuki, T Mori, DE Chang,o J Diruggier, CH Johnson, L Hood, NS. Baliga: ''A predictive model for transcriptional control of physiology in a free living cell.'' In: ''[[Cell (Zeitschrift)|Cell]]'', 2007 Dec 28, 131(7), S. 1354–1365, PMID 18160043.

== Weblinks ==
{{Commonscat}}
* [http://www.worldcommunitygrid.org/research/hpf2/overview.do Offizielle Homepage] (englisch)
* {{Webarchiv | url=http://www.systemsbiology.org/Scientists_and_Research/Technology/Data_Visualization_and_Analysis/Human_Proteome_Folding_Project | wayback=20051107041637 | text=HUMAN PROTEOME FOLDING PROJECT – Informationen zum Projekt}}

== Einzelnachweise ==
<references />

[[Kategorie:Berkeley Open Infrastructure for Network Computing]]
[[Kategorie:Proteinstruktur]]
[[Kategorie:New York University]]
[[Kategorie:University of Washington]]

Human Proteome Folding Project - Versionsgeschichte

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