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'''GROMOS''' bezeichnet zum einen ein [[Kraftfeld (Computerphysik)|Kraftfeld]], wie es zur Berechnung [[Moleküldynamik|molekulardynamischer]] Simulationen benötigt wird.<ref>C. Oostenbrink, A. Villa, A.E. Mark and W.F. van Gunsteren: "A biomolecular force field based on the free enthalpy of hydration and solvation: the GROMOS force-field parameter sets 53A5 and 53A6" [[Journal of Computational Chemistry]] 25, 2004, 1656–1676.</ref><ref>Lukas D. Schuler, Xavier Daura, Wilfred F. van Gunsteren: ''An improved GROMOS96 force field for aliphatic hydrocarbons in the condensed phase.'' Journal of Computational Chemistry 22 (11), August 2001, 1205–1218.</ref> Es wurde an der [[Universität Groningen]] und der [[ETH Zürich]] entwickelt. Zum anderen ist GROMOS der Name für ein Softwarepaket für molekulardynamische Simulationen, das mit diesen Kraftfeldparametern verbunden ist.<ref>W.F. van Gunsteren, S.R. Billeter, A.A. Eising, P.H. Hünenberger, P. Krüger, A.E. Mark, W.R.P. Scott, I.G. Tironi: ''Biomolecular Simulation: The GROMOS96 Manual and User Guide'', vdf Hochschulverlag AG an der ETH Zürich and BIOMOS b.v.: Zürich, Groningen, 1996.</ref> Die aktuelle Version trägt die Bezeichnung GROMOS11.

Das GROMOS-Kraftfeld, oder besser die Kraftfelder, da es verschiedene Versionen gibt, die sich in ihren Parametern unterscheiden, ist für die Simulation von [[Aminosäuren]] und [[Alkane]]n optimiert, ist aber auch für [[Protein]]e oder [[Zucker]] einsetzbar. Es handelt sich um ein ''united atom'' Kraftfeld, bei dem einige [[funktionelle Gruppe|funktionelle Gruppen]], das heißt solche mit unpolaren Wasserstoffatomen zu einer Einheit verschmolzen wurden und in der Simulation als ein [[Atom]] angesehen werden.

== Einzelnachweise ==
<references/>

== Weblinks ==
* [http://www.gromos.net About the GROMOS software for biomolecular Simulation]
* [http://www.gromos.net/page.pl?page=howtoget GROMOS11 Download]

{{SORTIERUNG:Gromos}}
[[Kategorie:Computerchemie]]
[[Kategorie:Computerphysik]]
[[Kategorie:Abkürzung]]

GROMOS - Versionsgeschichte

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