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2023-08-03T10:51:34Z

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'''Felsenstein 81''' (F81) ist eine von dem US-amerikanischen Wissenschaftler [[Joseph Felsenstein]] im Jahre 1981 entwickelte Methode, um [[Abstand|Distanzdaten]] von [[Sequenzalignment]]s zu korrigieren.<ref>{{Literatur |Autor=Volker Knoop, Kai Müller |Titel=Gene und Stammbäume: Ein Handbuch zur molekularen Phylogenetik |Verlag=Springer-Verlag |Datum=2009-06-02 |ISBN=9783827422309 |Online=https://books.google.de/books?id=lcYhBAAAQBAJ&pg=PA182&lpg=PA182&dq=Felsenstein+81&source=bl&ots=bwlGZLYQA4&sig=ACfU3U36vP71UuNq7HoOIT4e34ucGAIM4g&hl=de&sa=X&ved=2ahUKEwiRuMrtmJrgAhXB0KQKHXnNCQ0Q6AEwBXoECAUQAQ#v=onepage&q=Felsenstein%2081&f=false |Abruf=2019-02-01}}</ref>

Um einen Stammbaum zu konstruieren, werden [[Homologie (Genetik)|orthologe Sequenzen]] von [[Genom]]abschnitten, meist von [[Gen]]en untereinander geschrieben und „sinnvoll“ aneinander abgeglichen (Erstellung eines multiplen [[Sequenzalignment]]s). Daraus können dann Stammbäume erstellt werden. Dafür gibt es zwei grundlegende Vorgehensweisen. Entweder wird jeder einzelne Charakter ([[Aminosäure]] bei [[Protein]]sequenzen oder [[Nukleinbasen|Basen]] bei [[Desoxyribonukleinsäure|DNA]]) ([[charakter-orientierte Stammbaumerstellung]]) verglichen, oder die einzelnen Stellen werden in so genannte Distanzdaten umgewandelt. Dabei werden die Abstände der Charaktere voneinander berechnet und daraus eine Matrix erstellt, mit der die Sequenzen verglichen werden können ([[matrix-orientierte Stammbaumerstellung]]).

Da es mit der Zeit auch [[Rückmutation]]en gibt, müssen die rohen Distanzwerte korrigiert werden.

F81 geht im Gegensatz zu [[Jukes & Cantor]] oder [[Kimura-2-Parameter]] davon aus, dass die [[Nukleotid]]zusammensetzung unterschiedlich ist.
Bei F81 wird wie bei Jukes & Cantor angenommen, dass die Umwandlung der Basen oder Aminosäuren ineinander mit gleicher Wahrscheinlichkeit stattfindet.

== Einzelnachweise ==
<references />

[[Kategorie:Bioinformatik]]

Felsenstein 81 - Versionsgeschichte

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