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[[Datei:Dnaconformations.png|mini|Seitenansicht und Obenansicht von A-, B- und Z-DNA]]
'''B-DNA''' ist eine der möglichen [[Doppelhelix]]-[[Konformation|Strukturen]] von [[Desoxyribonukleinsäure|DNA]].<ref>D. L. Beveridge, T. E. Cheatham, M. Mezei: ''The ABCs of molecular dynamics simulations on B-DNA, circa 2012.'' In: ''Journal of biosciences.'' Band 37, Nummer 3, Juli 2012, S. 379–397, PMID 22750978, {{PMC|4029509}}.</ref>

== Eigenschaften ==
B-DNA ist eine rechtsgängige doppelsträngige DNA-Doppelhelix, die im Vergleich zur A-Form entspannter ist und deren [[Nukleinbase]]n orthogonal zur Helixachse ausgerichtet sind. B-DNA ist die unter physiologischen Bedingungen typisch vorliegende Form doppelsträngiger DNA, z. B. bei [[Chromosom]]en in [[Zelle (Biologie)|Zellen]].<ref>A. S. Boyer, S. Grgurevic, C. Cazaux, J. S. Hoffmann: ''The human specialized DNA polymerases and non-B DNA: vital relationships to preserve genome integrity.'' In: ''Journal of molecular biology.'' Band 425, Nummer 23, November 2013, S. 4767–4781, [[doi:10.1016/j.jmb.2013.09.022]], PMID 24095858.</ref> Andere DNA-Strukturen sind z. B. [[A-DNA]], [[Z-DNA]], ''hairpin, triplex, cruciform, left-handed Z-form, tetraplex'' und ''A-motif''.<ref>J. Choi, T. Majima: ''Conformational changes of non-B DNA.'' In: ''Chemical Society reviews.'' Band 40, Nummer 12, Dezember 2011, S. 5893–5909, [[doi:10.1039/c1cs15153c]], PMID 21901191.</ref> Aufgrund der entspannteren Form besitzt B-DNA im Vergleich zu A-DNA eine kleinere Anzahl an Nukleinbasen pro Windung der Helix, eine flachere große Furche, eine tiefere kleine Furche und ist um etwa 30 % länger pro Windung.<ref>M. C. Wahl, M. Sundaralingam: ''Crystal structures of A-DNA duplexes.'' In: ''Biopolymers.'' Band 44, Nummer 1, 1997, S. 45–63, PMID 9097733, {{DOI|10.1002/(SICI)1097-0282(1997)44:1<45::AID-BIP4>3.0.CO;2-#}}.</ref>

== Doppelsträngige DNA-Strukturen (dsDNA) ==
[[Datei:Bdna cropped.gif|mini|B-DNA]]
[[Datei:B&Z&A DNA formula.svg|mini|Helixachse (gelbe Punkte) in Bezug auf [[Guanosin]]-[[Cytidin]]-Basenpaarungen bei A-, B- und Z-DNA]]
[[Datei:CCF10292011 00000.jpg|mini|Basenpaargeometrien]]

{| class="wikitable"
|-
! Geometrie
! A-Form
! B-Form
! Z-Form
|-
|Helix-Drehrichtung ||style="text-align:center"| rechtsgängig ||style="text-align:center"| rechtsgängig ||style="text-align:center"| linksgängig
|-
|Wiederholungseinheit ||style="text-align:right"| 1 bp ||style="text-align:right"| 1 bp ||style="text-align:right"| 2 bp
|-
|Rotation/bp ||style="text-align:right"| 33,6° ||style="text-align:right"| 34,6° ||style="text-align:right"| 60°/2
|-
|bp/Windung ||style="text-align:right"| 11 ||style="text-align:right"| 10,4 ||style="text-align:right"| 12
|-
|Inklination der bp zur Achse ||style="text-align:right"| +19° ||style="text-align:right"| −1,2° ||style="text-align:right"| −9°
|-
|Länge/bp entlang der Achse ||style="text-align:right"| 2,4 Å (0,24 nm)||style="text-align:right"| 3,4 Å (0,34 nm)||style="text-align:right"| 3,7 Å (0,37 nm)
|-
|Länge/Windung ||style="text-align:right"| 24,6 Å (2,46 nm)||style="text-align:right"| 33,2 Å (3,32 nm)||style="text-align:right"| 45,6 Å (4,56 nm)
|-
|Biegung (propeller twist) ||style="text-align:right"| +18° ||style="text-align:right"| +16° ||style="text-align:right"| 0°
|-
|Glycosylwinkel ||style="text-align:center"| anti ||style="text-align:center"| anti ||style="text-align:center"| Pyrimidin: anti,<br /> Purin: syn
|-
|Phosphatabstand ||style="text-align:center"| 5,9 Å || style="text-align:center"| 7,0 Å || align="center" | C: 5,7 Å,<br />G: 6,1 Å
|-
|Glycosylflexibilität (sugar pucker) ||style="text-align:center"| C3’-endo ||style="text-align:center"| C2'-endo ||style="text-align:center"| C: C2'-endo,<br />G: C3’-endo
|-
|Durchmesser ||style="text-align:right"| 23 Å (2,3 nm)||style="text-align:right"| 20 Å (2,0 nm)||style="text-align:right"| 18 Å (1,8 nm)
|}

== Literatur ==
* E. Girard, T. Prangé, A. C. Dhaussy, E. Migianu-Griffoni, M. Lecouvey, J. C. Chervin, M. Mezouar, R. Kahn, [[Roger Fourme|R. Fourme]]: ''Adaptation of the base-paired double-helix molecular architecture to extreme pressure.'' In: ''Nucleic acids research.'' Band 35, Nummer 14, 2007, S. 4800–4808, [[doi:10.1093/nar/gkm511]], PMID 17617642, {{PMC|1950552}}.
* P. Cysewski: ''The post-SCF quantum chemistry characteristics of inter- and intra-strand stacking interactions in d(CpG) and d(GpC) steps found in B-DNA, A-DNA and Z-DNA crystals.'' In: ''Journal of molecular modeling.'' Band 15, Nummer 6, Juni 2009, S. 597–606, [[doi:10.1007/s00894-008-0378-9]], PMID 19039609.

== Weblinks ==
* [https://jenalib.leibniz-fli.de/ImgLibDoc/nana/IMAGE_NANA.html Nucleic Acid Nomenclature] (englisch).

== Einzelnachweise ==
<references />

{{SORTIERUNG:BDNA}}
[[Kategorie:Desoxyribonukleinsäure]]
[[Kategorie:Abkürzung]]

B-DNA - Versionsgeschichte

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