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Als '''Assembler''' wird in der [[Bioinformatik]] ein Computerprogramm bezeichnet, das virtuelle [[Nukleotidsequenz]]en durch [[Sequenzalignment]]s zu längeren Fragmenten zusammenführt. Dabei wird eine durch eine [[Shotgun Sequencing|Shotgun-Sequenzierung]] gewonnene Menge kurzer DNA-Sequenzen (eng. ''reads'') so angeordnet, dass sie das ursprüngliche [[Genom]] ergeben.

== Software ==
''AMOS'' (''A Modular, Open-Source assembler'') ist ein Open-Source-Projekt, das sich zum Ziel gesetzt hat, einen modularen und quelloffenen Assembler zu schaffen. Das Projekt wurde am [[Institute for Genomic Research]] von Steven Salzberg, Mihai Pop und Art Delcher entwickelt.

Der [[Celera Assembler]] wurde von Gene Myers, Granger Sutton und Art Delcher bei [[Celera]] von 1998 bis 2002 entwickelt. Seitdem wird das Projekt auf [[SourceForge]] weiterentwickelt.

Der [[Arachne Assembler]] wurde 2000 von Serafim Batzoglou im Rahmen seiner Doktorarbeit ins Leben gerufen. Seitdem wird er durch ein Team, geleitet von David B. Jaffe, am [[Broad Institute]] weiterentwickelt.<ref>[http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=43 Software Packages for Next Generation Sequence Analysis - SeqAnswers]</ref>

== Siehe auch ==
* [[Shotgun Sequencing]]
* [[DNA-Sequenzierung]]

== Einzelnachweise ==
<references />

== Weblinks ==
* [http://celeragb.sourceforge.net/ SourceForge Projekt]

[[Kategorie:Bioinformatik]]

Assembler (Bioinformatik) - Versionsgeschichte

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